More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4935 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  66.8 
 
 
500 aa  660    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  83.47 
 
 
503 aa  823    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  95.21 
 
 
532 aa  950    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  80.63 
 
 
515 aa  818    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  67.91 
 
 
501 aa  668    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
508 aa  1005    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  83.07 
 
 
503 aa  838    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  66.54 
 
 
509 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  83.47 
 
 
503 aa  823    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  64.46 
 
 
503 aa  631  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 
544 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  63.4 
 
 
502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 
502 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
496 aa  592  1e-168  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  62.14 
 
 
519 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 
531 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  59.58 
 
 
509 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 
529 aa  581  1e-164  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 
506 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 
507 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 
507 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 
506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 
526 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 
526 aa  555  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 
547 aa  550  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5801  histidyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 
550 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 
497 aa  521  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 
505 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
500 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  55.58 
 
 
494 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  54.67 
 
 
494 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
543 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  51.1 
 
 
494 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 
492 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
444 aa  251  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
439 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  31.8 
 
 
453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
454 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
454 aa  230  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 
442 aa  230  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  31.81 
 
 
458 aa  229  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 
466 aa  229  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 
470 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
466 aa  227  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
454 aa  223  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  32.15 
 
 
453 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  34.33 
 
 
457 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  33.62 
 
 
465 aa  219  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  31.21 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
458 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  29.92 
 
 
462 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
475 aa  206  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
439 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  30.26 
 
 
428 aa  201  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  31.16 
 
 
462 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 
462 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 
459 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
456 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  32.24 
 
 
438 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
440 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
460 aa  189  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  31.49 
 
 
434 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 
444 aa  187  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 
432 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  30.31 
 
 
481 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  28.7 
 
 
448 aa  182  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  32.47 
 
 
458 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  32.83 
 
 
482 aa  179  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
421 aa  179  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 
419 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.75 
 
 
425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  29.37 
 
 
436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
425 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
425 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 
425 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  31.05 
 
 
413 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
425 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  29.12 
 
 
536 aa  170  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 
426 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 
426 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 
456 aa  169  1e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  34.26 
 
 
453 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  28.05 
 
 
425 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 
447 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  31.71 
 
 
417 aa  168  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 
442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 
421 aa  167  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  31.09 
 
 
431 aa  166  9e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 
459 aa  161  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  32.76 
 
 
440 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06400  histidine-tRNA ligase, putative  29.48 
 
 
586 aa  158  3e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 
431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
418 aa  156  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  31.9 
 
 
441 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
450 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>