More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3187 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3187  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 484 aa  959    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2915  histidyl-tRNA synthetase  83.44 
 
 		 484 aa  744    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2187  histidyl-tRNA synthetase 2  57.23 
 
 		 479 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3835  histidine--tRNA ligase  50.33 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000618349  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0577  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  35.66 
 
 		 517 aa  327  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  28.72 
 
 		 418 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  29.35 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  28.06 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 408 aa  183  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  29.61 
 
 		 421 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  30.51 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  34.24 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  31.46 
 
 		 431 aa  170  7e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 439 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 		 409 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  27.18 
 
 		 439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1302  histidyl-tRNA synthetase  27.64 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.194766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  28.89 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2198  histidyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  29.12 
 
 		 425 aa  156  9e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  29.58 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  31.57 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  31.04 
 
 		 446 aa  154  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 425 aa  153  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  25.98 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  30.96 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 		 444 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  31.14 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  29.96 
 
 		 454 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 		 400 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  28.6 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0661  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.17 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0588271  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  29.25 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  30.82 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  30.36 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  30.43 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0553  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.52 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264933  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  31.86 
 
 		 445 aa  147  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  28.3 
 
 		 413 aa  146  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  25.49 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  28.31 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  30.86 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 		 464 aa  142  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  32.07 
 
 		 430 aa  143  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3307  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  28.26 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0566  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.05 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1336e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3259  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29.65 
 
 		 434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0331239  hitchhiker  0.000000000000235665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  30.66 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0519  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  29 
 
 		 445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  29.7 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_002620  TC0830  histidyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 428 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  27.02 
 
 		 417 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  27.07 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88696  predicted protein  26.77 
 
 		 525 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1873  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0653  histidyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 434 aa  138  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  27.6 
 
 		 448 aa  137  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  29.55 
 
 		 401 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 		 426 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  22.69 
 
 		 428 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  28.45 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 		 462 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23920  predicted protein  26.46 
 
 		 503 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.350117  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  27.81 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3252  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.81 
 
 		 429 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  30.39 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  28.51 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.53 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>