More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1369 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 509 aa  1034    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  71.65 
 
 		 547 aa  719    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 		 526 aa  717    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  72.03 
 
 		 519 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  73.55 
 
 		 531 aa  767    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  71.73 
 
 		 526 aa  739    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  67.03 
 
 		 544 aa  697    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 509 aa  615  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  63.12 
 
 		 500 aa  611  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  60.16 
 
 		 501 aa  588  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  61.45 
 
 		 503 aa  585  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 532 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  59.58 
 
 		 508 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 507 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 507 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 506 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 502 aa  551  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  58.82 
 
 		 515 aa  554  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 502 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 506 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 529 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5801  histidyl-tRNA synthetase  54.86 
 
 		 550 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 503 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 503 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 492 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 500 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  51.37 
 
 		 494 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  34.06 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 439 aa  229  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 454 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 453 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  33.54 
 
 		 453 aa  220  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 442 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 475 aa  207  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  32.7 
 
 		 449 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 458 aa  204  3e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 432 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  31.38 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 		 456 aa  199  7e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 417 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  30.52 
 
 		 467 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  30.89 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  30.88 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 465 aa  193  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 466 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 		 466 aa  191  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 		 462 aa  189  8e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 462 aa  187  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  31.13 
 
 		 431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 459 aa  184  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 448 aa  177  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  32.45 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  31.17 
 
 		 481 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 		 454 aa  174  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  30.42 
 
 		 421 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00046  histidyl-tRNA synthetase, mitochondrial precursor (AFU_orthologue; AFUA_4G12920)  31.66 
 
 		 549 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.45 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  31.93 
 
 		 440 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  28.79 
 
 		 428 aa  170  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 		 425 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 425 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  28.26 
 
 		 425 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  31.61 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  28.19 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  31.97 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  30.77 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 426 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  28.41 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  27.83 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  27.97 
 
 		 456 aa  162  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  27.75 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  28.6 
 
 		 536 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1986  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  27.62 
 
 		 438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0054  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 415 aa  157  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 		 431 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  26.84 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  30.8 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  31.67 
 
 		 441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>