More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1819 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 442 aa  889    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  94.57 
 
 		 440 aa  820    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 		 445 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  64.59 
 
 		 453 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 		 459 aa  525  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 451 aa  519  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1806  histidyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114177  normal  0.246433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  61.16 
 
 		 450 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  56.43 
 
 		 460 aa  503  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  58.73 
 
 		 447 aa  495  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 457 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  50.86 
 
 		 482 aa  455  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  51.83 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  50.92 
 
 		 440 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 462 aa  289  8e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 462 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 470 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 428 aa  269  8e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 481 aa  266  5.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 		 444 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 453 aa  243  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 453 aa  232  8.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 448 aa  218  2e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  31.53 
 
 		 456 aa  213  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 462 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  34.72 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  31.5 
 
 		 475 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 449 aa  205  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 458 aa  196  9e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 456 aa  195  1e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 506 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  34.98 
 
 		 494 aa  189  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 		 505 aa  187  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  31.95 
 
 		 503 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  33.11 
 
 		 492 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 500 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  32.22 
 
 		 519 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 503 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 509 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  34.49 
 
 		 503 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  32.99 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 		 526 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 494 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  33.47 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  31.55 
 
 		 531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 532 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 		 547 aa  173  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  30.94 
 
 		 526 aa  172  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  32.67 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 		 507 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 507 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  35.07 
 
 		 439 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 501 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  32.62 
 
 		 508 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 431 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 		 544 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  30.38 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  30.97 
 
 		 496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 502 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  30.5 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  30.25 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  30.45 
 
 		 425 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  29.84 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 500 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0299  histidyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  32.25 
 
 		 498 aa  147  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 		 529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  31.73 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  30.09 
 
 		 438 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5801  histidyl-tRNA synthetase  29.67 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  28.77 
 
 		 421 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>