More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1216 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  68.27 
 
 
532 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  66.94 
 
 
502 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
509 aa  1006    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  66.4 
 
 
501 aa  639    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 
500 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  66.73 
 
 
502 aa  635    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 
508 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  67.81 
 
 
503 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1740  histidyl-tRNA synthetase  64.67 
 
 
544 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.965854  normal  0.114975 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1178  histidyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 
496 aa  633  1e-180  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.534741  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 
509 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  64.98 
 
 
503 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  64.65 
 
 
519 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  65.1 
 
 
515 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  64.88 
 
 
507 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 
503 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  64.83 
 
 
503 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  64.09 
 
 
506 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  61.33 
 
 
531 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3017  histidyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 
529 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  62.88 
 
 
547 aa  601  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  63.44 
 
 
526 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  62.67 
 
 
507 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  60.46 
 
 
526 aa  588  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  60 
 
 
506 aa  581  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5801  histidyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
550 aa  537  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  57.09 
 
 
500 aa  513  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 
505 aa  504  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 
497 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
492 aa  501  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  55.62 
 
 
494 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  51.95 
 
 
543 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 
498 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
494 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 
494 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
444 aa  250  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
442 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
432 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  31.47 
 
 
458 aa  211  3e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 
470 aa  209  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 
457 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  32.2 
 
 
467 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  32.74 
 
 
466 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 
440 aa  203  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 
459 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  30.55 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  31.12 
 
 
453 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 
466 aa  200  5e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  33.48 
 
 
454 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
462 aa  199  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  30.4 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 
448 aa  194  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 
439 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 
465 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  30.75 
 
 
454 aa  190  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  31.78 
 
 
438 aa  189  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  33.26 
 
 
444 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  29.46 
 
 
458 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  30.69 
 
 
462 aa  187  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
454 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 
431 aa  184  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  29.77 
 
 
449 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  29.34 
 
 
456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  29.42 
 
 
462 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  32.9 
 
 
442 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  27.63 
 
 
475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  31.33 
 
 
421 aa  178  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
453 aa  177  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.39 
 
 
419 aa  176  9e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0658  histidyl-tRNA synthetase  31.32 
 
 
427 aa  176  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269942  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.63 
 
 
434 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  33.63 
 
 
440 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
417 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
458 aa  171  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  32.11 
 
 
460 aa  171  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  33.19 
 
 
441 aa  170  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
425 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  31.94 
 
 
457 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  32.89 
 
 
459 aa  167  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  28.44 
 
 
536 aa  167  5e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 
436 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 
425 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  27.93 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  26.72 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  28.09 
 
 
426 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  31.1 
 
 
421 aa  164  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
418 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  31.03 
 
 
482 aa  163  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
418 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 
445 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  26.78 
 
 
456 aa  161  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 
447 aa  160  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  27.25 
 
 
426 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  28.35 
 
 
418 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>