More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1360 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1360  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 459 aa  939    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.606926  normal  0.473517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1680  histidyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 453 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17610  histidyl-tRNA synthetase  68.9 
 
 		 466 aa  613  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0391362 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2003  histidyl-tRNA synthetase  65.27 
 
 		 450 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0370885  normal  0.0805206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1806  histidyl-tRNA synthetase  68.05 
 
 		 463 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114177  normal  0.246433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1819  histidyl-tRNA synthetase  59.51 
 
 		 442 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.425645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1809  histidyl-tRNA synthetase  59.69 
 
 		 440 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.796045  hitchhiker  0.000022389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2293  histidyl-tRNA synthetase  60.44 
 
 		 447 aa  524  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14040  histidyl-tRNA synthetase  58.09 
 
 		 460 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3817  histidyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0784  histidine--tRNA ligase  57.27 
 
 		 482 aa  508  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2023  histidyl-tRNA synthetase  59.65 
 
 		 457 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000257055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1335  histidyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 441 aa  491  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.452029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2397  histidyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 		 451 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165814  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12810  histidyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0017  histidyl-tRNA synthetase  57.67 
 
 		 447 aa  474  1e-132  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.6817  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0759  histidyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1194  histidyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0221904  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3548  histidyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 440 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.458882  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3608  histidyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0758  histidyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 467 aa  286  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1947  histidyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2602  histidyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 462 aa  279  6e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1753  histidyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 465 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.058114 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09630  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0725744  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1363  histidyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000622801  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00827  histidyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 470 aa  270  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00186389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2260  histidyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 462 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1355  histidyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 466 aa  262  8.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1422  histidyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 466 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0025  histidyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 444 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1143  histidyl-tRNA synthetase  33.77 
 
 		 453 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.8111  normal  0.0102442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2673  histidyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0257  histidyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 458 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.828616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0173  histidyl-tRNA synthetase  32.4 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1442  histidyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10378  histidyl-tRNA synthetase  33.04 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.549064  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0121  histidyl-tRNA synthetase  32.84 
 
 		 454 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2062  histidyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2008  histidyl-tRNA synthetase  33.97 
 
 		 454 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0284  histidyl-tRNA synthetase  31.59 
 
 		 458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0449199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4574  histidyl-tRNA synthetase  32.65 
 
 		 457 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.819707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5052  histidyl-tRNA synthetase  30.93 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.504123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7026  histidyl-tRNA synthetase  32.14 
 
 		 449 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1240  histidyl-tRNA synthetase  32.27 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0135  histidyl-tRNA synthetase  30.61 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0287  histidyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1925  histidyl-tRNA synthetase  31.99 
 
 		 494 aa  175  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0968692  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0503  histidyl-tRNA synthetase  32.81 
 
 		 500 aa  173  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2246  histidyl-tRNA synthetase  32.5 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000301109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2955  histidyl-tRNA synthetase  31.6 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48972  normal  0.0224984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0945  histidyl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1834  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1555  histidyl-tRNA synthetase  31.85 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.84291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0599  histidyl-tRNA synthetase  31.66 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0139702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1216  histidyl-tRNA synthetase  32.31 
 
 		 509 aa  163  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0422  histidyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00502968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23400  histidyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.879527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4290  histidyl-tRNA synthetase  31.26 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0425698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4935  histidyl-tRNA synthetase  30.22 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1686  histidyl-tRNA synthetase  31.24 
 
 		 503 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.685076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1776  histidyl-tRNA synthetase  31.4 
 
 		 500 aa  157  6e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.375411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0598  histidyl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 506 aa  156  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16944  predicted protein  31.51 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.994947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2647  histidyl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.708997  normal  0.141234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0805  histidyl-tRNA synthetase  32.1 
 
 		 501 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0510234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0299  histidyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0532706 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1185  histidyl-tRNA synthetase  30.6 
 
 		 526 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445744  normal  0.165943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3351  histidyl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3354  histidyl-tRNA synthetase  31.11 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3348  histidyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.650464  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3551  histidyl-tRNA synthetase  30.06 
 
 		 494 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1902  histidyl-tRNA synthetase  29.62 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3329  histidyl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 425 aa  148  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0169  histidyl-tRNA synthetase  31.51 
 
 		 502 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.101592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3024  histidyl-tRNA synthetase  29.91 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.49218  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3117  histidyl-tRNA synthetase  30.58 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.375001  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  33.01 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1009  histidine--tRNA ligase  32.41 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3130  histidyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3376  histidyl-tRNA synthetase  30.34 
 
 		 425 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3951  histidyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 		 494 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0501682 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0187  histidyl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 502 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0893  histidyl-tRNA synthetase  32.52 
 
 		 519 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1369  histidyl-tRNA synthetase  29.32 
 
 		 509 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0999423  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3154  histidyl-tRNA synthetase  29.81 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.447073  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70094  histidine tRNA synthetase  30.99 
 
 		 536 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.768048  normal  0.208592 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0082  Histidine--tRNA ligase  35.46 
 
 		 425 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0403  histidyl-tRNA synthetase  33.64 
 
 		 507 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.326468  normal  0.0636459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0509  histidyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 506 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0149047 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0464  histidyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.469042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3054  histidyl-tRNA synthetase  29.5 
 
 		 431 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1289  histidyl-tRNA synthetase  30.74 
 
 		 531 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.219331 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2533  histidyl-tRNA synthetase  30.83 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4681  histidyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 		 498 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  27.65 
 
 		 421 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3489  histidyl-tRNA synthetase  29.89 
 
 		 434 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  29.6 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3234  histidyl-tRNA synthetase  27.57 
 
 		 543 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1522  histidyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.221368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>