205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1585 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 314 aa  609  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  66.67 
 
 		 279 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  37.37 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  36.18 
 
 		 361 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  33.1 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  31.2 
 
 		 256 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  30.72 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  31.25 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  29.77 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  27.21 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  28.52 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  31.35 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  30.25 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  29.32 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  28.47 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  28.47 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  28.47 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  28.47 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  28.47 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  29.84 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  32.33 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  29.76 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  31.43 
 
 		 604 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  29.31 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  29.44 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  28.11 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  29.44 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  29.44 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  29.44 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  29.54 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  31.51 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  29.44 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  29.44 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  29.44 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  29.44 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  28.01 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  27.66 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  30.23 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  29.67 
 
 		 269 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  28.03 
 
 		 313 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  28.69 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  30.27 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  32.19 
 
 		 244 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  25.93 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  28.1 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  25.59 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  29.15 
 
 		 625 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  29.55 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  30.23 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  31.25 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  33.77 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  27.19 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  33.77 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  33.77 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  30.58 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  26.77 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  30.92 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  28.2 
 
 		 732 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  27.2 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  27.45 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  30.23 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  33.85 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  27.23 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  27.72 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  27.72 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  26.64 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  28.28 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  29.09 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  24.44 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  28.31 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  25.83 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  29.25 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  28.92 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  26.49 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  25.82 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  27.65 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  26.05 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  28.02 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  26.97 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  27.14 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  27.91 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  26.41 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  26.05 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  26.79 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  25.97 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  26.19 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  27.66 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  30.46 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  26.89 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  33.33 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  26.62 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  27.13 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  25.53 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  26.99 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  29.1 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  25.37 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  23.77 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  24.82 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  27.68 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  27.21 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>