165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2299 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  63.77 
 
 		 625 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  59.53 
 
 		 604 aa  687    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 732 aa  1448    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  57.84 
 
 		 325 aa  333  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  58.12 
 
 		 764 aa  313  6.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  43.61 
 
 		 820 aa  294  3e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  42.6 
 
 		 770 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  50.72 
 
 		 745 aa  254  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  40.25 
 
 		 786 aa  238  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  30.62 
 
 		 313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  30.62 
 
 		 313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  30.62 
 
 		 313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  31.72 
 
 		 289 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  30.62 
 
 		 313 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  30.62 
 
 		 313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  32.3 
 
 		 256 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  30.47 
 
 		 310 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  30.47 
 
 		 310 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  30.47 
 
 		 310 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  30.47 
 
 		 310 aa  104  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  30.47 
 
 		 310 aa  104  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  30.47 
 
 		 310 aa  104  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  30.47 
 
 		 310 aa  104  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  30.47 
 
 		 310 aa  104  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  30.47 
 
 		 310 aa  104  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  29.86 
 
 		 307 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  29.52 
 
 		 269 aa  103  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  32.05 
 
 		 279 aa  101  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  31.94 
 
 		 346 aa  99.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  29.86 
 
 		 361 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  30.12 
 
 		 309 aa  98.6  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  30.22 
 
 		 284 aa  98.2  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  31.91 
 
 		 311 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  32.34 
 
 		 302 aa  97.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  31.58 
 
 		 311 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  30.19 
 
 		 268 aa  96.3  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  29.17 
 
 		 313 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  29.37 
 
 		 307 aa  94.7  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  27.69 
 
 		 306 aa  94.4  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  29.68 
 
 		 319 aa  92  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  28.21 
 
 		 318 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  29.12 
 
 		 317 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  27.46 
 
 		 289 aa  87.4  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  30.84 
 
 		 295 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  29.2 
 
 		 290 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  29.39 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  31.28 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  27.35 
 
 		 295 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  27.92 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  28.95 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  27.35 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  28.95 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  28.95 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  30.67 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  27.34 
 
 		 278 aa  76.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3730  UspA domain protein  26.74 
 
 		 293 aa  73.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  27.46 
 
 		 286 aa  72  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  28.2 
 
 		 314 aa  70.1  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  28.27 
 
 		 303 aa  70.1  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  30.53 
 
 		 262 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  24.89 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  28.64 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  26.2 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  26.2 
 
 		 283 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  25 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  25.45 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  28.83 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  25.11 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  25.11 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  25.11 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  25.11 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  25.11 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  27.1 
 
 		 279 aa  60.1  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  25.77 
 
 		 275 aa  60.5  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  25.78 
 
 		 508 aa  60.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  25.76 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2630  UspA domain protein  27.27 
 
 		 298 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  25.42 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  26.76 
 
 		 303 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  24.92 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  26.76 
 
 		 303 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  25 
 
 		 283 aa  60.1  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  26.95 
 
 		 286 aa  60.1  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  23.81 
 
 		 862 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  23.3 
 
 		 310 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  21.93 
 
 		 863 aa  57  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  24.01 
 
 		 483 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  24.62 
 
 		 261 aa  56.2  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  26.69 
 
 		 286 aa  56.6  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  21.25 
 
 		 698 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  21.25 
 
 		 698 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  32.26 
 
 		 265 aa  55.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  21.5 
 
 		 276 aa  55.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  26.58 
 
 		 303 aa  55.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  27.74 
 
 		 316 aa  55.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  26.74 
 
 		 279 aa  55.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  21.63 
 
 		 537 aa  55.1  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  24.06 
 
 		 278 aa  54.7  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  23.47 
 
 		 301 aa  54.7  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  29.29 
 
 		 287 aa  54.3  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>