131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28170 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  100 
 
 		 318 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  87.74 
 
 		 317 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  69.12 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  69.96 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  68.63 
 
 		 298 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  71.1 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  68.27 
 
 		 298 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  69.2 
 
 		 311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  66.79 
 
 		 311 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  54.41 
 
 		 309 aa  295  8e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  59.06 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  55 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  55 
 
 		 310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  55 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  55 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  55 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  55 
 
 		 310 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  55 
 
 		 310 aa  288  7e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  55 
 
 		 310 aa  288  7e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  55 
 
 		 310 aa  288  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  55.64 
 
 		 313 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  55.64 
 
 		 313 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  55.64 
 
 		 313 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  55.64 
 
 		 313 aa  288  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  55.25 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  50.18 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  43.17 
 
 		 269 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  46.88 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  46.74 
 
 		 284 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  40.6 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  41.43 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  38.41 
 
 		 290 aa  212  7e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  41.22 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  35.29 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  39.16 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  41.51 
 
 		 289 aa  193  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  40.99 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  40.64 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  38.08 
 
 		 268 aa  186  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  33.93 
 
 		 286 aa  185  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  39.01 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  39.46 
 
 		 244 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  31.43 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  30.77 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  29.77 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  26.61 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  27.34 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  25.16 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  30.74 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  27.96 
 
 		 625 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  28.21 
 
 		 732 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 604 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  26.23 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  28.92 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  22.51 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  26.61 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  24.03 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  21.9 
 
 		 286 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  27.18 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  26.11 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  27.42 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  27.42 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  27.62 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  27.07 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  22.75 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  24.88 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  31.39 
 
 		 265 aa  53.9  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  27.17 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  27.17 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  27.17 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  26.5 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  27.17 
 
 		 271 aa  53.1  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  26.88 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  25.41 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  26.87 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  24.88 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  27.13 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  25.74 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  25.74 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  25.74 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  25.74 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  25.74 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  24.16 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  27.6 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  22.51 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  23.7 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  24.84 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  27.81 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  24.75 
 
 		 283 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  26 
 
 		 270 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  23.35 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  23.35 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  24.75 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  22.39 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  25.98 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  26.36 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  29.86 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  22.45 
 
 		 277 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  22.27 
 
 		 483 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  21.77 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>