99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3392 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  100 
 
 		 309 aa  634    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  67.41 
 
 		 313 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  67.41 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  67.41 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  67.41 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  67.41 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  67.44 
 
 		 313 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  71.22 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  71.22 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  71.22 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  71.22 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  71.22 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  71.22 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  71.22 
 
 		 310 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  70.86 
 
 		 310 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  70.86 
 
 		 310 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  62.79 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  57.19 
 
 		 278 aa  318  9e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  56.4 
 
 		 298 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  56.9 
 
 		 298 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  58.91 
 
 		 295 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  53.44 
 
 		 298 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  53.4 
 
 		 298 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  55.56 
 
 		 317 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  54.41 
 
 		 318 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  54.45 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  55.51 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  51.57 
 
 		 269 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  43.45 
 
 		 284 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  38.33 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  39.85 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  36.55 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  38.7 
 
 		 295 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  40.46 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  38.36 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  36.7 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  36.08 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  38.1 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  36.36 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  38.19 
 
 		 288 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  35.86 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  40.17 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  32.38 
 
 		 256 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  26.32 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  27.21 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  28.2 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  27.13 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  29.74 
 
 		 732 aa  99.4  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  27.5 
 
 		 346 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  26.86 
 
 		 604 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  23.41 
 
 		 625 aa  78.6  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  22.83 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  25.1 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  24.45 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  24.03 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  29.03 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  24.03 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  24.03 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  28.64 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  28.64 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  28.64 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  25.87 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  23.6 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  23.6 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  22.3 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  28.77 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  24.02 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  28.17 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  28.17 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  27.7 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  27.4 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  24.02 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  24.02 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  24.02 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  24.02 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  24.02 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  27.19 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  24.56 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  28.37 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  28.37 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1640  formate/nitrite transporter  23.14 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00257653  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  25.83 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  22.22 
 
 		 277 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  22.82 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  26.72 
 
 		 287 aa  49.3  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  28.02 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  24.49 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0716  formate/nitrite transporter  22.37 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  21.88 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  24.62 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  28.11 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  25.1 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  21.66 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  22.93 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  25.13 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  22.38 
 
 		 275 aa  43.1  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  26.53 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  21.96 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>