115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2513 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2513  putative transport  100 
 
 		 278 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  57.19 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  57.09 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  56.73 
 
 		 313 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  57.14 
 
 		 313 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  57.14 
 
 		 313 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  57.14 
 
 		 313 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  58.91 
 
 		 310 aa  322  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  58.53 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  58.53 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  58.53 
 
 		 310 aa  319  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  58.53 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  58.53 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  58.53 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  58.53 
 
 		 310 aa  319  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  58.14 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  56.3 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  59.06 
 
 		 318 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  59.45 
 
 		 317 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  56.83 
 
 		 298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  56.83 
 
 		 298 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  57.19 
 
 		 298 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  56.83 
 
 		 298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  55.04 
 
 		 295 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  55.76 
 
 		 311 aa  294  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  52.59 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  56.88 
 
 		 311 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  53.68 
 
 		 306 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  49.19 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  43.68 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  40.7 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  43.18 
 
 		 267 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  46.5 
 
 		 302 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  42.21 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  39.93 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  38.52 
 
 		 268 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  38.43 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  39.82 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  39.38 
 
 		 295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  35.91 
 
 		 286 aa  179  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  42.59 
 
 		 288 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  42.15 
 
 		 244 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  32.81 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  33.06 
 
 		 307 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  35.04 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  32.11 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  29.76 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  27.67 
 
 		 625 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  34.12 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  30.72 
 
 		 361 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  29.75 
 
 		 604 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  27.34 
 
 		 732 aa  91.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  27.45 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  25.4 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  30.91 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  26.24 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  28.25 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  22.35 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  24.04 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  24.52 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  25.1 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  25.1 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  25.1 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  23.9 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  24.3 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  24.52 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  24.04 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  24.04 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  24.04 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  24.04 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  24.02 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  24.52 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  24.04 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  24.04 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  26.26 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  27.48 
 
 		 270 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  24.65 
 
 		 494 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  23.67 
 
 		 277 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  20 
 
 		 483 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  20.29 
 
 		 483 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  22.69 
 
 		 483 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  25.13 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  25 
 
 		 508 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  22.54 
 
 		 493 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  24.17 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  23.72 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  24.86 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  23.85 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  24.04 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  25.88 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  26.85 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  29.45 
 
 		 226 aa  45.8  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  24.53 
 
 		 286 aa  45.4  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  23.77 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  22.8 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  23.4 
 
 		 289 aa  45.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  25.7 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  24.41 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  24.34 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  24.4 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>