132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5278 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  100 
 
 		 295 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  78.82 
 
 		 298 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  77.21 
 
 		 298 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  78.12 
 
 		 298 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  78.05 
 
 		 298 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  75.34 
 
 		 311 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  74.66 
 
 		 311 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  69.12 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  68.75 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  58.91 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  55.04 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  55.28 
 
 		 313 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  55.28 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  55.28 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  55.28 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  55.28 
 
 		 313 aa  298  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  54.55 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  54.55 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  54.55 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  54.55 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  54.55 
 
 		 310 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  54.18 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  54.18 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  54.18 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  54.18 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  54.12 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  47.76 
 
 		 269 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  53.68 
 
 		 306 aa  271  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  42.45 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  41.09 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  40.22 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  42.44 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  40.77 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  38.72 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  38.01 
 
 		 307 aa  195  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  37.08 
 
 		 286 aa  191  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  40.88 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  42.31 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  40.45 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  42.31 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  35 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  39.41 
 
 		 244 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  32.53 
 
 		 256 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  33.61 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  26.88 
 
 		 361 aa  99.8  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  28.1 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 307 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  31.15 
 
 		 732 aa  97.8  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  27.57 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  27.76 
 
 		 346 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  28.7 
 
 		 625 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  26.41 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  25.1 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  27.62 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  26.39 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  22.88 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  24.29 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  24.56 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  25.4 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  25.4 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  25.4 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  22.99 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  22.79 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  22.79 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  22.79 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  22.79 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  34.4 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  23.35 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  22.43 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  23.77 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  23.77 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  24.89 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  24.89 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  24.89 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  24.89 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  24.89 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  24.44 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  26.09 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  24.7 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  25.45 
 
 		 284 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  25.98 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  25.7 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  25.7 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  24.14 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  26.11 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  24 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  26.11 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  24.3 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  26.92 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  23.53 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  26.07 
 
 		 271 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  26.44 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  23.81 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  26.09 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  27.03 
 
 		 271 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  26.6 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  23.02 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  23.02 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  27.42 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>