208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1014 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 279 aa  540  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  66.67 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  37.88 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  36.74 
 
 		 361 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  37.6 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  32.97 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  34.4 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  30.12 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  32.97 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  31.34 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  35.37 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  28.95 
 
 		 309 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  31.72 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  30.86 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  31.52 
 
 		 318 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  31.72 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  30.08 
 
 		 317 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  29.63 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  29.63 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  29.63 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  29.63 
 
 		 313 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  35.04 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  29.37 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  29.62 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  29 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  30 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  29.12 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  30.67 
 
 		 289 aa  99  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  29.23 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  29.23 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  29.23 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  26.32 
 
 		 269 aa  99  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  29.12 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  29.12 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  29.12 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  29.12 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  30.17 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  28.47 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  28.37 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  27.57 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  29.74 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  31.01 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  29.45 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  30.69 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  32.21 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  33.2 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  30.5 
 
 		 282 aa  85.9  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  28.68 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  28.79 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  29.67 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  28.06 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  33.48 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  29.01 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  26.2 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  26.69 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  29.06 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  29.48 
 
 		 604 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  25.54 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  32.67 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  29.52 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  29.52 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  29.52 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  29.79 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  29.52 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  29.52 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  29.52 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  29.07 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  29.07 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  29.07 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  32.94 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  31.95 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  37.59 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  33.57 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  33.57 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  33.57 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  25.54 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  27.16 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  27.27 
 
 		 276 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  27.78 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  24.08 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  26.5 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  24.9 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  24.52 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  27.1 
 
 		 732 aa  63.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  26.15 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  27.82 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  27.13 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  26.64 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  24.53 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  25.77 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  24.81 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  28.75 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  26.61 
 
 		 537 aa  59.3  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  25.97 
 
 		 483 aa  58.9  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  26.87 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  28.85 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  24.53 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  24.64 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>