101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1061 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 270 aa  527  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  64.21 
 
 		 275 aa  351  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  61.62 
 
 		 312 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  61.25 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  61.25 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  61.25 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  59.18 
 
 		 265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  55.6 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  53.33 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  30.52 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  28.79 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  26.62 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  26.56 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  28.77 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  25.29 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  24.9 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  28.3 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  24.91 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  26.64 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  25.31 
 
 		 280 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  25 
 
 		 361 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  25.23 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  22.71 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  29.38 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  29.38 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  27.31 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  28.7 
 
 		 625 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  22.71 
 
 		 310 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  22.71 
 
 		 310 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  22.71 
 
 		 310 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  25.83 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  24.61 
 
 		 306 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  22.71 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  23.36 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  20.88 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  22.71 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  22.71 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  28.75 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  24.9 
 
 		 732 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  22.71 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  27.27 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  26.13 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  31.73 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  22.81 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  25.6 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  28.1 
 
 		 307 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  22.27 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  22.7 
 
 		 313 aa  50.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  24.59 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  28.68 
 
 		 604 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  29.11 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  29.11 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  29.11 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  29.11 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  29.11 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  26.09 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  26.09 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  26.09 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  26.09 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  31.43 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  25.57 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  25.11 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  25.37 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  32.35 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  24.88 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47526  Probable formate transporter 1 (Formate channel 1)  27.01 
 
 		 444 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  25.52 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  27.69 
 
 		 325 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  25.52 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  29.31 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  26.8 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  24.62 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  25.33 
 
 		 285 aa  45.8  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  26.89 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  29.53 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  24.68 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  24.68 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  24.68 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  30.5 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  22.27 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  28 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  26.09 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  27.65 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  25.11 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  29.68 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  28.57 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  24.37 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  26.05 
 
 		 296 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  31.13 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  25.36 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  29.36 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  24.3 
 
 		 278 aa  42  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>