208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2071 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 325 aa  645    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  59.32 
 
 		 625 aa  363  2e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  60.06 
 
 		 604 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  57.84 
 
 		 732 aa  333  3e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  34.23 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  31.18 
 
 		 269 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  30.77 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  31.45 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  35.62 
 
 		 311 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  31.86 
 
 		 346 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  34.98 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  26.32 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  29.93 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  30.88 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  29.29 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  29.84 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  32.77 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  27.12 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  32.77 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  30.51 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  32.88 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  26.35 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  29.45 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  27.96 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  27.56 
 
 		 313 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  27.56 
 
 		 313 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  27.56 
 
 		 313 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  27.96 
 
 		 313 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  33.61 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  28.77 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  25.27 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  29.84 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  25.27 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  25.27 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  25.27 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  25.27 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  29.83 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  27.27 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  32.11 
 
 		 278 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  30.23 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  32 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  29.08 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  26.26 
 
 		 290 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  31.01 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  30.95 
 
 		 288 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  32.73 
 
 		 244 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  25.17 
 
 		 286 aa  89  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  26.94 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  29.25 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  31.35 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  23.9 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  27.64 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  27.44 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  26.03 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  25.48 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  24.28 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  27.8 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  24.61 
 
 		 508 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  23.48 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  24.6 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  24.14 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  27.32 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  26.34 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  26.42 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1500  formate transporter  25.96 
 
 		 547 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  26.34 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  26.34 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  25.3 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  23.56 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  23.56 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  28.34 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  25.58 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  23.56 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  23.96 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  25.48 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  26.75 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  25.95 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  23.85 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  27.67 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  27.67 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  23.18 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  27.67 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  27.67 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  33.02 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  23.35 
 
 		 491 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  25.56 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  25.23 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  21.8 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  21.54 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  24.61 
 
 		 270 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  25.89 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  27.55 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  21.07 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  27.71 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  27.55 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  27.55 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  27.71 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>