131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1210 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  58.04 
 
 
288 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  61.47 
 
 
244 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  49.64 
 
 
284 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  43.42 
 
 
289 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  44.09 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  43.99 
 
 
295 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  40.6 
 
 
318 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  43.99 
 
 
295 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  41.07 
 
 
317 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  41.09 
 
 
295 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  38.97 
 
 
313 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  37.24 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  41.84 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  37.93 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  41.13 
 
 
298 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  36.9 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  36.9 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  198  9e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  40.78 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  41.13 
 
 
298 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  36.55 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  36.08 
 
 
309 aa  195  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  46.5 
 
 
278 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  41.54 
 
 
279 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  36.49 
 
 
313 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  36.49 
 
 
313 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  36.49 
 
 
313 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  36.21 
 
 
313 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  39.71 
 
 
311 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  39.35 
 
 
311 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  38.46 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  37.12 
 
 
268 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  37.36 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  39.08 
 
 
306 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  31.86 
 
 
307 aa  168  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  33.81 
 
 
286 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  31.51 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  34.29 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  29.53 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  32.61 
 
 
279 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  28.9 
 
 
307 aa  104  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  32.33 
 
 
314 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  32 
 
 
325 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  33.78 
 
 
625 aa  97.4  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  32.34 
 
 
732 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
604 aa  91.3  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  23.75 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  23.28 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  24.23 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  24.23 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  24.23 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  23.21 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  24.23 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  24.23 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  24.23 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  24.23 
 
 
283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  23.79 
 
 
283 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  21.55 
 
 
252 aa  56.2  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  27.37 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  27.37 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  27.37 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  26.09 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  27.17 
 
 
278 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  32.46 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  22.61 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  24.47 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  25.9 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  28.65 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  28.19 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  28.11 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  28.19 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  21.31 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  24.87 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  27.57 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  27.59 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  28.19 
 
 
271 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  23.63 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  28.19 
 
 
271 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  27.03 
 
 
271 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  21.9 
 
 
273 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  21.9 
 
 
273 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  21.83 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  26.09 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  21.83 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  21.83 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  21.83 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  21.83 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  21.9 
 
 
273 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  22.96 
 
 
289 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  21.9 
 
 
273 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  23.63 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  21.12 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  23.89 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  27.13 
 
 
271 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>