88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B2533 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  99.68 
 
 		 313 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  100 
 
 		 313 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  100 
 
 		 313 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  99.36 
 
 		 313 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  100 
 
 		 313 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  87.87 
 
 		 310 aa  544  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  87.87 
 
 		 310 aa  544  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  87.87 
 
 		 310 aa  544  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  87.54 
 
 		 310 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  87.54 
 
 		 310 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  87.54 
 
 		 310 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  87.54 
 
 		 310 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  87.21 
 
 		 310 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  87.16 
 
 		 313 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  87.21 
 
 		 310 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  67.41 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  70 
 
 		 306 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  57.14 
 
 		 278 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  55.05 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  53.97 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  52.45 
 
 		 317 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  52.33 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  55.05 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  53.56 
 
 		 298 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  55.64 
 
 		 318 aa  288  9e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  57.2 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  51.17 
 
 		 298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  53.94 
 
 		 269 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  40.93 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  39.08 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  39.52 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  39.93 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  41.22 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  36.49 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  36.59 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  36.84 
 
 		 289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  37.37 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  40.16 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  34.29 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  37.02 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  36.14 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  37.08 
 
 		 244 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  33.47 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  29.79 
 
 		 307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  29.9 
 
 		 732 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  27.56 
 
 		 325 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  26.05 
 
 		 625 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  29.63 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  28.47 
 
 		 314 aa  102  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  30.77 
 
 		 604 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  27.72 
 
 		 346 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  25.47 
 
 		 361 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  24.21 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  27.34 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  27.52 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  21.03 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  22.39 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  22.06 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  23.9 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  22.39 
 
 		 283 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  21.03 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  21.03 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  26.44 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  24.53 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  20.66 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  20.66 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  20.66 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  21.95 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  25.86 
 
 		 287 aa  49.7  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  26.09 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  20.66 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  29.37 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  23.53 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  22.97 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  23.38 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  23.38 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  23.38 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  23.38 
 
 		 271 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  24.63 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  22.64 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  23.53 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  24.51 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  27.22 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  27.22 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  27.22 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  25.85 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  20.95 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  24.02 
 
 		 269 aa  43.1  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>