147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3646 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  100 
 
 		 272 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  81.55 
 
 		 275 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  83.39 
 
 		 312 aa  431  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  61.25 
 
 		 270 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  55.06 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  52.61 
 
 		 265 aa  222  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  53.5 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  33.6 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  27.57 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  25.8 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  27.21 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  26.25 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  26.79 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  23.24 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  28.71 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  33.68 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  27.82 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  26.72 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  29.3 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  34.27 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  29.67 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  24.29 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  25.1 
 
 		 732 aa  62.8  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  24.9 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  27.8 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  25.39 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  24.37 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  25.39 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  23.02 
 
 		 625 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  27.39 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  25.18 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  23.97 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  26.71 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  23.63 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  23.66 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  24.67 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  24.03 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  23.88 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  26.22 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  23.53 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  24.25 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  24.62 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  24.42 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  25.85 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  25.85 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  25.85 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  23.14 
 
 		 604 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  25.85 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  25.37 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  25.69 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  19.76 
 
 		 325 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  26.05 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  26.05 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  26.05 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  26.05 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  26.05 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  22.85 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  27.59 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  26.05 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  26.05 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  26.05 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  26.05 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  23.39 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  23.39 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  25.7 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  26.37 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  24.42 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  24.58 
 
 		 508 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  21.88 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  23.34 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  22.98 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  23.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  22.98 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  23.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  22.98 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  23.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  22.98 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  23.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  23.14 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  23.83 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  25.1 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  22.66 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  27.62 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  22.58 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  24.71 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  24.34 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  24.06 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  24.03 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  29.52 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  23.37 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>