127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1015 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  100 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  81.55 
 
 		 272 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  81.55 
 
 		 272 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  81.55 
 
 		 272 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  77.49 
 
 		 312 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  64.21 
 
 		 270 aa  332  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  52.02 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  52.65 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  46.85 
 
 		 226 aa  176  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  26.06 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  27.38 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  27.38 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  26.3 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  25.34 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  29.25 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  31.95 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  25.09 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  25.75 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  24.4 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  25 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  25.42 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  28.5 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  26.36 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  23.94 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  25.87 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  32.99 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  25 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  23.63 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  27.06 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  25.28 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  25.88 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  27 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  24.33 
 
 		 346 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  25.65 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  23.9 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  23.2 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  23.9 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  23.9 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  23.9 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  24.32 
 
 		 732 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  21.62 
 
 		 325 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  28.89 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  28.89 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  28.89 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  28.89 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  28.89 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  25.9 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  22.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  22.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  22.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  22.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  22.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  22.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  22.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  24.36 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  22.96 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  27.52 
 
 		 625 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  25.69 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  27.67 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  24.64 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  22.96 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  26.44 
 
 		 244 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  22.91 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  26.26 
 
 		 309 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  24.72 
 
 		 290 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  24.64 
 
 		 289 aa  48.9  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  25.45 
 
 		 281 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  34.02 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  25.58 
 
 		 508 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  25.91 
 
 		 317 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  25.5 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  26.5 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  25.55 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  26.56 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  26.63 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  23.85 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  25.39 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  32.99 
 
 		 324 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  25.09 
 
 		 280 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  32.99 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  23.39 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  23.39 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  23.39 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  24.54 
 
 		 271 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  23.55 
 
 		 281 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  22.1 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  25.19 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  21.68 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  25.19 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  24.36 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  28.08 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>