106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3500 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  100 
 
 		 276 aa  537  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  51.72 
 
 		 275 aa  248  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1061  formate/nitrite transporter  53.82 
 
 		 270 aa  241  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  54.47 
 
 		 312 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  54.05 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  54.05 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  54.05 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  50.39 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15970  formate/nitrite transporter family protein  52.31 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  32.8 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  27.95 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  27.59 
 
 		 732 aa  77  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  27.8 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  25.33 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  27.44 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  27.82 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  27.44 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  27.44 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  28.95 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  26.37 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  24.71 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  24.81 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  27.27 
 
 		 625 aa  68.9  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  24.14 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  26.51 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  25.34 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  24.81 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  24.81 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  24.81 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  24.81 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  26.75 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  25.09 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  26.71 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  23.86 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  25.53 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  26.39 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  24.91 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  27.05 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  26.6 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  23.21 
 
 		 361 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  25.09 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  31.47 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  28.19 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  26.89 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  26.92 
 
 		 604 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  21.83 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  27.75 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  25.82 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  25.66 
 
 		 298 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  24.88 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  25.22 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  27.19 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  28.03 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  25.22 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  22.64 
 
 		 295 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  30.48 
 
 		 267 aa  52.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  32.76 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  23.64 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  28.1 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  29.23 
 
 		 292 aa  48.9  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  26.57 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  22.69 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  31.09 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  25 
 
 		 537 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  24.69 
 
 		 483 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  25.33 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  23.81 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  27.82 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  25.46 
 
 		 508 aa  46.6  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  28.51 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  24.49 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  22.77 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  25.17 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  23.61 
 
 		 558 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  26.17 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  22.82 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  25.95 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  22.81 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  22.32 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  22.81 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47526  Probable formate transporter 1 (Formate channel 1)  24.89 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  22.43 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  22.43 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  22.43 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  23.5 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  22.43 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  31.15 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  22.81 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  24 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  24.53 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  23.53 
 
 		 483 aa  42.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  22.92 
 
 		 483 aa  42  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  22.48 
 
 		 285 aa  42  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  22.48 
 
 		 285 aa  42  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  22.48 
 
 		 285 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>