237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1674 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  61.39 
 
 		 625 aa  728    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 604 aa  1196    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  59.87 
 
 		 732 aa  698    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  60.06 
 
 		 325 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  52.84 
 
 		 764 aa  271  4e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  50.91 
 
 		 820 aa  258  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  46.76 
 
 		 745 aa  223  8e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  44.64 
 
 		 770 aa  210  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  45.68 
 
 		 786 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  29.89 
 
 		 307 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  29.97 
 
 		 289 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  32.79 
 
 		 256 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  28.76 
 
 		 269 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  28.93 
 
 		 306 aa  107  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  30.77 
 
 		 313 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  30.77 
 
 		 313 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  30.77 
 
 		 313 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  30.77 
 
 		 313 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  32.93 
 
 		 279 aa  103  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  30.95 
 
 		 268 aa  102  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  31.43 
 
 		 314 aa  101  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  30.56 
 
 		 346 aa  101  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  101  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  101  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  28.62 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  101  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  29.75 
 
 		 310 aa  100  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  29.75 
 
 		 310 aa  100  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  28.34 
 
 		 361 aa  100  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  29.75 
 
 		 310 aa  100  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  100  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  29.75 
 
 		 310 aa  100  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  29.76 
 
 		 317 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  33.33 
 
 		 302 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  28.57 
 
 		 318 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  29.76 
 
 		 311 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  30.19 
 
 		 311 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  29.75 
 
 		 278 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  30.85 
 
 		 284 aa  93.2  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  28.08 
 
 		 290 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  28.88 
 
 		 289 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  26.86 
 
 		 309 aa  90.1  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  29.64 
 
 		 267 aa  90.1  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  31.19 
 
 		 244 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  28.7 
 
 		 298 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  29.52 
 
 		 295 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  27.6 
 
 		 298 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  29.52 
 
 		 295 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  28.4 
 
 		 313 aa  88.6  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  28.24 
 
 		 298 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  31.38 
 
 		 288 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  28.95 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  28.02 
 
 		 286 aa  83.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  28.35 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  29.37 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  28.85 
 
 		 262 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  24.9 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  24 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  27.13 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  25.2 
 
 		 286 aa  67  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  25.55 
 
 		 310 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  29.21 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  28.01 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  24.52 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  24.76 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  26.36 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  23.11 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  22.86 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  22.86 
 
 		 283 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  22.86 
 
 		 283 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  22.86 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  27.1 
 
 		 270 aa  62  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  22.86 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  23.27 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  21.82 
 
 		 698 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  25.6 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  21.17 
 
 		 698 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  25.84 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  23.96 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  23.77 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  23.32 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  22.42 
 
 		 283 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  26.02 
 
 		 271 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  30.25 
 
 		 293 aa  60.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  25 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  25.75 
 
 		 792 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  21.48 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  23.81 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  27.27 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  25.46 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  25.3 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  26.87 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  26.26 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  29.71 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  25.4 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  22.42 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  25.51 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  25.77 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>