229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2705 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  61.39 
 
 		 604 aa  711    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 625 aa  1247    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  63.71 
 
 		 732 aa  753    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  59.32 
 
 		 325 aa  363  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  57.75 
 
 		 764 aa  320  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  47.84 
 
 		 820 aa  313  5.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  50.36 
 
 		 745 aa  259  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  48.1 
 
 		 770 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  48.63 
 
 		 786 aa  248  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  29.87 
 
 		 269 aa  114  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  30 
 
 		 289 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  33.33 
 
 		 279 aa  111  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  29.5 
 
 		 307 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  31.3 
 
 		 256 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  28.34 
 
 		 307 aa  107  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  26.05 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  26.05 
 
 		 313 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  26.05 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  26.05 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  26.05 
 
 		 313 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  29.48 
 
 		 268 aa  100  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  26.49 
 
 		 310 aa  98.6  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  26.49 
 
 		 310 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  26.49 
 
 		 310 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  26.49 
 
 		 310 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  32.71 
 
 		 244 aa  98.2  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  26.71 
 
 		 310 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  26.71 
 
 		 310 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  26.71 
 
 		 310 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  26.71 
 
 		 310 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  33.78 
 
 		 302 aa  97.4  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  26.49 
 
 		 310 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  28.57 
 
 		 346 aa  96.7  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  28.08 
 
 		 361 aa  96.3  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  27.96 
 
 		 318 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  30.03 
 
 		 317 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  25.4 
 
 		 306 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  30.67 
 
 		 295 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  31 
 
 		 289 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  29.82 
 
 		 311 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  30.67 
 
 		 295 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  31.03 
 
 		 311 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  32.17 
 
 		 319 aa  91.3  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  31.58 
 
 		 288 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  29.15 
 
 		 314 aa  90.9  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  27.67 
 
 		 278 aa  90.5  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  28.07 
 
 		 290 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  29.11 
 
 		 298 aa  87  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  30.8 
 
 		 284 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  24.65 
 
 		 313 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  29.11 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  29.44 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1215  amino acid permease-associated region  29.11 
 
 		 792 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2630  UspA domain protein  31.73 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  28.06 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  27.7 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  29.84 
 
 		 295 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  23.41 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  30.24 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  27.93 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  23.55 
 
 		 863 aa  75.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  27.67 
 
 		 310 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3730  UspA domain protein  27.97 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  23.66 
 
 		 879 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  23.66 
 
 		 879 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  24.39 
 
 		 698 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  22.67 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1707  sodium/hydrogen exchanger  24.04 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  28.71 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  25.36 
 
 		 862 aa  68.2  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  27.18 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  24.9 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  27.85 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  25.89 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4722  sodium/hydrogen exchanger  23.83 
 
 		 692 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  32.43 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  25.5 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  25 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  23.02 
 
 		 859 aa  63.9  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  25.33 
 
 		 283 aa  63.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  25.39 
 
 		 483 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  24.45 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  24.45 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  24.45 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  24.45 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  25.64 
 
 		 863 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4122  UspA domain protein  28.19 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  24.45 
 
 		 283 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  26.22 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  21.28 
 
 		 753 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  26.19 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  24.69 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  25 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  23.63 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  28.71 
 
 		 316 aa  59.3  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  23.41 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  25.68 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2626  sodium/hydrogen exchanger  23.88 
 
 		 722 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  25.61 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  22.79 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>