142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1851 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1851  formate/nitrate transporter  100 
 
 		 346 aa  694    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2139  formate/nitrate transporter  86.39 
 
 		 361 aa  580  1e-164  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1585  formate/nitrite transporter  37.37 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1014  formate/nitrite transporter  37.88 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.809249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4084  formate/nitrite transporter  33.67 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0709  putative transport protein, YfdC-like protein  30.67 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  0.184089 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2071  formate/nitrite transporter  31.86 
 
 		 325 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1210  putative transport protein, YfdC-like protein  29.53 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3126  transporter, putative  29.87 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2455  formate/nitrate transporter  28.62 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28170  formate/nitrate transporter  26.61 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0065988  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3296  transporter, putative  30.18 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.50461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1703  putative transport protein, YfdC-like protein  33.47 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0727  formate/nitrate transporter  31.33 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3392  putative inner membrane protein  27.5 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.265029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2299  formate/nitrite transporter  31.94 
 
 		 732 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.546024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1674  formate/nitrite transporter  30.56 
 
 		 604 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.368591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3606  hypothetical protein  27.76 
 
 		 284 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2705  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 625 aa  96.7  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2886  putative transport  27.27 
 
 		 313 aa  96.3  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4770  putative transport protein, YfdC-like protein  32.47 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.543572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4338  formate/nitrite transporter  28.73 
 
 		 269 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1645  hypothetical protein  27.44 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0441  putative transport protein, YfdC-like protein  30 
 
 		 289 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267412  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02273  predicted inner membrane protein  29.11 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2622  inner membrane protein YfdC  27.72 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2533  inner membrane protein YfdC  27.72 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2582  inner membrane protein YfdC  27.72 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.300415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3492  hypothetical protein  29.11 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02234  hypothetical protein  29.11 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2747  inner membrane protein YfdC  27.72 
 
 		 313 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.147844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2499  hypothetical protein  29.11 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2644  hypothetical protein  29.11 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1306  putative transport  29.11 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.134789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2507  hypothetical protein  29.11 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2730  hypothetical protein  29.11 
 
 		 310 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2636  hypothetical protein  27.15 
 
 		 313 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000369454 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1310  formate/nitrite transporter  29.11 
 
 		 310 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.330595  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0373  putative transport protein, YfdC-like protein  29.71 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2827  formate/nitrite transporter  26.91 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5278  formate/nitrate transporter  27.76 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1173  formate/nitrate transporter  31.06 
 
 		 298 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000225808  hitchhiker  0.0010745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0405  formate/nitrite transporter  29.29 
 
 		 295 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2513  putative transport  34.12 
 
 		 278 aa  85.9  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4258  formate/nitrate transporter  28.36 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000136807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0063  hypothetical protein  28.94 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1190  formate/nitrate transporter  28.99 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000136621  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1156  formate/nitrate transporter  32.2 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0151697  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01110  putative transporter (formate/nitrite transporter family) protein  27.67 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.298042  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5413  transporter formate/nitrite transporter family  31.77 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0209866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3567  hypothetical protein  30.2 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3922  transport protein, putative  31.39 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.94798 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  26.23 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  26.23 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  26.23 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  26.23 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  26.23 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  26.43 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  26.87 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  26.1 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  25.51 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  26.25 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  26.87 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  25.49 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  32.49 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  27.57 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  25.19 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  24.37 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  24.29 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  29.47 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  23.48 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  28.92 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1015  formate/nitrate transporter  24.33 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1583  formate/nitrite transporter  26.59 
 
 		 262 aa  53.9  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  27.59 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3646  formate/nitrate transporter  25 
 
 		 272 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3719  formate/nitrate transporter  25 
 
 		 272 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3659  formate/nitrate transporter  25 
 
 		 272 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.02842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  26.24 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06260  formate/nitrite transporter family protein  30.71 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  27.13 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  26.48 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  27.45 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3500  formate/nitrite family of transporters-like protein  24.19 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.999349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  26.54 
 
 		 271 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  25.17 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  22.81 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4123  formate/nitrate transporter  23.32 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.319246 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  25.59 
 
 		 271 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  23.31 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  25.59 
 
 		 271 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  26.24 
 
 		 274 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  25.59 
 
 		 271 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  25.88 
 
 		 558 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  25.59 
 
 		 271 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  25.59 
 
 		 271 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  25.59 
 
 		 271 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  25.69 
 
 		 493 aa  49.7  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  25.86 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  25.65 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>