247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1500 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1500  formate transporter  100 
 
 		 547 aa  1094    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  42.97 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  40.95 
 
 		 558 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  44.06 
 
 		 491 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  42.6 
 
 		 494 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  40.75 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  42.12 
 
 		 493 aa  349  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  35.47 
 
 		 483 aa  320  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  35.97 
 
 		 483 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  34.72 
 
 		 483 aa  306  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  52.74 
 
 		 324 aa  253  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  52.74 
 
 		 324 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  52.74 
 
 		 324 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  52.63 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  52.63 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  52.63 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  52.63 
 
 		 330 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  52.32 
 
 		 324 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  46.64 
 
 		 286 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  46.56 
 
 		 286 aa  223  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  44.11 
 
 		 285 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  44.11 
 
 		 285 aa  221  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  44.11 
 
 		 285 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  45 
 
 		 285 aa  220  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  45.75 
 
 		 286 aa  217  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  44.32 
 
 		 286 aa  216  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  45.82 
 
 		 285 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  41.84 
 
 		 303 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  44 
 
 		 275 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  44.22 
 
 		 271 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  44.22 
 
 		 285 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  43.82 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  43.82 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  43.82 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  43.82 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  45.71 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  41.98 
 
 		 285 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  43.82 
 
 		 286 aa  208  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  44.22 
 
 		 286 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  44.35 
 
 		 296 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2639  putative formate transporter  36.36 
 
 		 282 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.501611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3714  putative formate transporter  35.97 
 
 		 282 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.854705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2774  putative formate transporter  35.97 
 
 		 282 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0138397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  36.36 
 
 		 282 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  36.36 
 
 		 282 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  36.36 
 
 		 282 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0550252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  36.36 
 
 		 282 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  36.36 
 
 		 282 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  38.57 
 
 		 301 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  37.5 
 
 		 316 aa  151  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  36.02 
 
 		 313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  37.97 
 
 		 301 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  37.21 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  36.96 
 
 		 287 aa  141  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  38.86 
 
 		 278 aa  141  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  38.76 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2864  formate/nitrite transporter  35.96 
 
 		 234 aa  138  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.666076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  34.62 
 
 		 293 aa  131  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  34.52 
 
 		 279 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  41.92 
 
 		 269 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  34.31 
 
 		 269 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  34.53 
 
 		 282 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  37.24 
 
 		 425 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  32.51 
 
 		 301 aa  118  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  34.63 
 
 		 292 aa  113  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  33.72 
 
 		 283 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  33.72 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  32.08 
 
 		 270 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  32.49 
 
 		 283 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  35.34 
 
 		 323 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  33.33 
 
 		 283 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  33.59 
 
 		 283 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  33.59 
 
 		 283 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  33.59 
 
 		 283 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  33.59 
 
 		 283 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  33.59 
 
 		 283 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  34.73 
 
 		 280 aa  110  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  32.69 
 
 		 283 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  41.03 
 
 		 265 aa  109  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  33.08 
 
 		 283 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  34.41 
 
 		 315 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  32.19 
 
 		 382 aa  107  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  32.12 
 
 		 276 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1640  formate/nitrite transporter  30.28 
 
 		 288 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00257653  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  36.61 
 
 		 261 aa  104  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 271 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  28.89 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  31.01 
 
 		 252 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  31.78 
 
 		 275 aa  100  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  31.94 
 
 		 277 aa  100  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  26.54 
 
 		 268 aa  99.4  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  31.27 
 
 		 274 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>