120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2281 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
198 aa  401  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  69.59 
 
 
198 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  64.8 
 
 
195 aa  271  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  65.31 
 
 
196 aa  271  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  64.92 
 
 
199 aa  268  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  60.82 
 
 
199 aa  266  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  61.46 
 
 
200 aa  261  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1995  hypothetical protein  33.71 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368022  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1921  hypothetical protein  33.71 
 
 
300 aa  91.7  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  34.59 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  31.77 
 
 
300 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  32.09 
 
 
302 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3091  protein of unknown function DUF218  30.27 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322539  normal  0.57374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1178  hypothetical protein  32.97 
 
 
221 aa  88.2  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.665154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1152  protein of unknown function DUF218  30.69 
 
 
245 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5216  protein of unknown function DUF218  34.43 
 
 
241 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0669  hypothetical protein  36.77 
 
 
238 aa  87  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.126167  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0578  hypothetical protein  36.99 
 
 
241 aa  84.7  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4865  hypothetical protein  32.4 
 
 
240 aa  84.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.765936  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0945  hypothetical protein  34.83 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.238786  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2193  hypothetical protein  32.43 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123189  normal  0.691165 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3256  hypothetical protein  37.74 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.143218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0836  hypothetical protein  36.42 
 
 
240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.891978  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2865  hypothetical protein  30 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  31.03 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2985  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 
234 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208738  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3089  hypothetical protein  31.45 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.99224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2376  hypothetical protein  32.65 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0665662 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  29.89 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2982  hypothetical protein  29.51 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.216517  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  29.67 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  29.31 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3070  protein of unknown function DUF218  28.48 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00556969  normal  0.0219592 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  27.72 
 
 
232 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  31.88 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  31.88 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0699  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.514208  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3011  hypothetical protein  30.63 
 
 
177 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  26.92 
 
 
264 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3219  hypothetical protein  26.77 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.175029  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  25 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  39.73 
 
 
264 aa  54.7  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  44.62 
 
 
268 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  34.11 
 
 
252 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  35.96 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.86 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3082  hypothetical protein  26.67 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000038787  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  29.58 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.67 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  42.86 
 
 
262 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  24.14 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3480  H+/gluconate symporter and related permease-like protein  30.77 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.266773 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  33.62 
 
 
262 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.85 
 
 
251 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  20.13 
 
 
192 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  28.99 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  39.68 
 
 
262 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  41.54 
 
 
280 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  29.91 
 
 
284 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  43.75 
 
 
264 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  42.31 
 
 
346 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.29 
 
 
251 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  27.91 
 
 
251 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  27.72 
 
 
211 aa  47.4  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  24.86 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.35 
 
 
235 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  24.08 
 
 
213 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  29.91 
 
 
199 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  25.16 
 
 
210 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  27.18 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  27.18 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  29.14 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  27.27 
 
 
375 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  27.27 
 
 
375 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  27.27 
 
 
375 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  24.52 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  25.93 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.59 
 
 
282 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.93 
 
 
280 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  26.23 
 
 
253 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.18 
 
 
282 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.7 
 
 
265 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  31.93 
 
 
280 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.7 
 
 
278 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  22.16 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  25.62 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  24.24 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  44.07 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  21.67 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  24.22 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  35.48 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  34.44 
 
 
214 aa  43.9  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  39.68 
 
 
267 aa  43.5  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  25.62 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  30.94 
 
 
262 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2970  protein of unknown function DUF218  29.94 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.606259  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  37.7 
 
 
278 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  29.13 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  35.59 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  36.67 
 
 
268 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>