75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3336 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  343  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1816  hypothetical protein  49.39 
 
 
166 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0359339  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 
242 aa  57.8  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  39.02 
 
 
253 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  40.23 
 
 
253 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  31.3 
 
 
199 aa  54.7  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  33.73 
 
 
256 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  30.95 
 
 
264 aa  52.4  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  34.94 
 
 
268 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  34.21 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  46.3 
 
 
265 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  46.3 
 
 
265 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  33.33 
 
 
256 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  32.2 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  35.44 
 
 
256 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  30.51 
 
 
199 aa  48.5  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  29.06 
 
 
188 aa  48.5  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  34.27 
 
 
244 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  29.37 
 
 
252 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  27.12 
 
 
375 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  27.12 
 
 
375 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.03 
 
 
264 aa  48.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  27.12 
 
 
375 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  28.15 
 
 
334 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  33.73 
 
 
268 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  32.17 
 
 
223 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  34.68 
 
 
244 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  31.07 
 
 
206 aa  47.4  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  26.4 
 
 
284 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  30.09 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  23.21 
 
 
346 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  29.82 
 
 
253 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  30.22 
 
 
256 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  35 
 
 
280 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  30 
 
 
251 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.74 
 
 
252 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  30.1 
 
 
206 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  31.71 
 
 
248 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  32.87 
 
 
244 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  30.65 
 
 
245 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  33.88 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  31.71 
 
 
233 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  33.75 
 
 
280 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  31.86 
 
 
461 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28 
 
 
262 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  31.71 
 
 
248 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  31.71 
 
 
248 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  32.53 
 
 
268 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  35.48 
 
 
198 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  31.71 
 
 
231 aa  44.3  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  26.61 
 
 
249 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  26.83 
 
 
237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  31.45 
 
 
244 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  26.61 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.05 
 
 
192 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  28.4 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.23 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  30.19 
 
 
251 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 
262 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  26.09 
 
 
182 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  26.09 
 
 
182 aa  42  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  31.09 
 
 
270 aa  41.6  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  28.39 
 
 
254 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  29.25 
 
 
251 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.94 
 
 
262 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  33.77 
 
 
260 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.33 
 
 
214 aa  41.2  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  28.12 
 
 
206 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.78 
 
 
263 aa  41.2  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.41 
 
 
263 aa  41.2  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  30.4 
 
 
246 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  28.74 
 
 
267 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  27.44 
 
 
189 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.95 
 
 
237 aa  40.8  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.27 
 
 
262 aa  40.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>