151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1322 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  54.84 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  53.44 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  53.6 
 
 		 248 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  54.37 
 
 		 246 aa  258  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  54.66 
 
 		 251 aa  252  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  53.85 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  52.23 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  52.94 
 
 		 264 aa  248  5e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  52.63 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  51.42 
 
 		 244 aa  248  7e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  52.23 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  52.54 
 
 		 233 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  50.4 
 
 		 244 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  50.21 
 
 		 231 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  35.74 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  32.16 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  33.2 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  35.2 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  36.7 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  34.58 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  34.58 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  33.47 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.06 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  32.47 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  33.48 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  32.47 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  32.47 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  32.47 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  34.04 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  32.24 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  35.06 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  29.37 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  29.73 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  31.91 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  29.37 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  27.61 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  33.14 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.12 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.07 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  34.07 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  24.26 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  25.81 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.6 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  25.28 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.34 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  29.09 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  26.58 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  28.03 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  27.56 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.89 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  25.23 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.44 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  24.15 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  26.45 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.2 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  25.67 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  26.59 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  26.92 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  25.37 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.16 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  27.07 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  28.25 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  26.1 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  25.18 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.51 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  26.2 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.25 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  28.87 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  24.64 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  27.83 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  24.86 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  28 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  30.45 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  27.22 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  30.24 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  26.04 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  25.33 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  22.18 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  25.88 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  27.07 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  27.07 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  27.07 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  27.07 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  25.46 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>