116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1816 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1816  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  343  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0359339  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3336  hypothetical protein  49.39 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1019  hypothetical protein  33.91 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000506367  unclonable  0.00000000514024 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  35.38 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06205  hypothetical protein  31.9 
 
 		 219 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.687571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  27.21 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  35.38 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  32.76 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  33.7 
 
 		 265 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.7 
 
 		 265 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2058  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.5 
 
 		 242 aa  51.6  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1496  hypothetical protein  27.73 
 
 		 375 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1772  hypothetical protein  27.73 
 
 		 375 aa  51.2  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000657641  normal  0.0639898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1601  hypothetical protein  27.73 
 
 		 375 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  27.74 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  28.69 
 
 		 336 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  27.74 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2098  hypothetical protein  27.94 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.864287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  31.39 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 		 244 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  29.6 
 
 		 262 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0471  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 		 216 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  27.37 
 
 		 192 aa  48.5  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  27.01 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  44.44 
 
 		 199 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  27.01 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 346 aa  47.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 280 aa  47.8  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  31.03 
 
 		 210 aa  47.8  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  28.99 
 
 		 213 aa  47.4  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  27.73 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  27.83 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  40 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  30.14 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  25.19 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  32.1 
 
 		 280 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  26 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  28.8 
 
 		 253 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  26 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  28.47 
 
 		 247 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.14 
 
 		 252 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  26.67 
 
 		 243 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0438  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  27.69 
 
 		 256 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  26.79 
 
 		 271 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  30.14 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  27.98 
 
 		 252 aa  45.1  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  29.71 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  30.23 
 
 		 214 aa  45.1  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  30.14 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.79 
 
 		 262 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  28.12 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  29.76 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  42.22 
 
 		 200 aa  44.3  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  29.92 
 
 		 225 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  28.1 
 
 		 194 aa  43.9  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  26.72 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  29.25 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  25.78 
 
 		 252 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1708  hypothetical protein  32.08 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.27 
 
 		 251 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  28.8 
 
 		 253 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  35.56 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  29.79 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  24.22 
 
 		 278 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  31.78 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.47 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  29.45 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  21.01 
 
 		 219 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  41.03 
 
 		 198 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  32.8 
 
 		 258 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  27.97 
 
 		 337 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  21.01 
 
 		 210 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  30.86 
 
 		 205 aa  42  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  21 
 
 		 264 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  27.21 
 
 		 205 aa  42  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  23.39 
 
 		 278 aa  42  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0775  hypothetical protein, putative phage gene  28.91 
 
 		 337 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.626314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  22.13 
 
 		 258 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  30.86 
 
 		 205 aa  41.6  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0864  hypothetical protein  27.21 
 
 		 315 aa  41.6  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898014  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  28 
 
 		 253 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  24.22 
 
 		 265 aa  41.6  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  28.29 
 
 		 254 aa  41.2  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  32.8 
 
 		 258 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  26.56 
 
 		 263 aa  41.2  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>