234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1217 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  37.21 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  35.53 
 
 		 237 aa  132  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  35.09 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.78 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  33.71 
 
 		 256 aa  88.2  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  35.59 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  31.28 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  29.39 
 
 		 287 aa  78.2  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  33.52 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  28.65 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.61 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  34.46 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  32.6 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.05 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  32.4 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  26.48 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  29.73 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  25.33 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  25.22 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  31.61 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  27.42 
 
 		 263 aa  68.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  28.33 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  26.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  26.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.34 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.73 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  34.27 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  26.09 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  25.32 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  27.89 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  28.65 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  30.51 
 
 		 284 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  27.36 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  27.36 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  29.71 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  30.32 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  27.13 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  29.14 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  27.19 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  27.03 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  26.87 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  26.87 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  28.99 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  32.6 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  29.03 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.97 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  28.07 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  30.34 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  28.9 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  27.85 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.86 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.64 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.27 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  24.31 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  28.24 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  27.81 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.73 
 
 		 265 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  26.18 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  26.47 
 
 		 262 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.73 
 
 		 278 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  31.84 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.03 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  27.04 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  38.1 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  26.97 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  27.6 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.99 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  32.61 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  32.61 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.34 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  35.9 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.34 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  27.54 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.44 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  27.31 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  29.55 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2388  hypothetical protein  32.08 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.623326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  32.08 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  31.13 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>