155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1189 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  85.66 
 
 
263 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  36.48 
 
 
255 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  34.26 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  35.37 
 
 
251 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  32.41 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  36.06 
 
 
255 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  33.92 
 
 
253 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  33.2 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  32.26 
 
 
225 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  31.62 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  30.35 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  32.57 
 
 
224 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  29.83 
 
 
260 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  31.8 
 
 
224 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  31.8 
 
 
224 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  32.11 
 
 
224 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  37.64 
 
 
240 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  37.64 
 
 
240 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  37.64 
 
 
240 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  37.64 
 
 
240 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  37.64 
 
 
240 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  37.64 
 
 
240 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  30.41 
 
 
224 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  25.71 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.15 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  25.1 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.42 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  25.83 
 
 
263 aa  79  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  26.21 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  27.82 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  26.58 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.74 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  26.22 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.92 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.92 
 
 
237 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  25.23 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  23.98 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  29.89 
 
 
284 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.96 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  28.29 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  26.46 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.79 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.99 
 
 
281 aa  62  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  25.63 
 
 
263 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  37.11 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  25.3 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  33.33 
 
 
219 aa  58.9  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  26.34 
 
 
236 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.13 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.13 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  23.79 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  27.5 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  29.8 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  26.05 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  33.64 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.55 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  29.94 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  30.92 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.7 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  24.19 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  26.05 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  35 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  34.04 
 
 
252 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  30.51 
 
 
215 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4551  membrane spanning protein  24.07 
 
 
345 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  26.2 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  26.82 
 
 
197 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4954  hypothetical protein  24.42 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  29.09 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  27.72 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  25.84 
 
 
345 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4694  hypothetical protein  24.07 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4534  hypothetical protein  26.44 
 
 
344 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5055  hypothetical protein  24.07 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.65 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  27.13 
 
 
275 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  24.51 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  31.11 
 
 
336 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  24.51 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  24.89 
 
 
282 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  24.51 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  32.61 
 
 
196 aa  49.7  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.35 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  31.78 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  25.4 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4919  hypothetical protein  26.29 
 
 
344 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.17 
 
 
287 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.82 
 
 
264 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  31.25 
 
 
282 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4633  hypothetical protein  28.1 
 
 
344 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>