More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1020 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
242 aa  486  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  44.17 
 
 
244 aa  179  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  34.55 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  34.23 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.3 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  37.04 
 
 
237 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  37.04 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  32.28 
 
 
256 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  35.9 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  33.01 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  31.76 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  30.68 
 
 
280 aa  111  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  30.83 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  34.72 
 
 
266 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  32.7 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.82 
 
 
263 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  27.24 
 
 
256 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  27.95 
 
 
251 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 
215 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  36.09 
 
 
252 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  30.04 
 
 
262 aa  104  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  31.1 
 
 
267 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.98 
 
 
260 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  31.08 
 
 
235 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 
264 aa  100  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.02 
 
 
266 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  33.98 
 
 
268 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  29.06 
 
 
268 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  35.68 
 
 
282 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  28.4 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.8 
 
 
282 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  32.6 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.18 
 
 
265 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  33.18 
 
 
265 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  29.64 
 
 
264 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.74 
 
 
281 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  28.45 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  27.82 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  34.5 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  26.64 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  28.57 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  31.08 
 
 
272 aa  95.9  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  30.32 
 
 
252 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  28.91 
 
 
278 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  31.51 
 
 
236 aa  95.1  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  31.09 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  28.52 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  31.33 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  28.06 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  27.03 
 
 
278 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  30.67 
 
 
268 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  28.24 
 
 
280 aa  91.7  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.87 
 
 
284 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.5 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  30.56 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.6 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  28.74 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  28.64 
 
 
253 aa  89.4  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  32 
 
 
264 aa  89  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  31.12 
 
 
262 aa  88.6  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  30.15 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  25.3 
 
 
251 aa  87.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  29.69 
 
 
253 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  35.2 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  26.89 
 
 
280 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  27.56 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  31.75 
 
 
244 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  29.37 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  30.12 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  32.27 
 
 
264 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  85.9  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  27.95 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  28.57 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  31.98 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  30.47 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  30.35 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  32.82 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  29.07 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  32 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  31.49 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  29.39 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  30.18 
 
 
268 aa  82  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  25.45 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  28.06 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  30.3 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  32.76 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  32.14 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31.5 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  32.54 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  29.46 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.15 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31.5 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31.5 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  25.1 
 
 
250 aa  80.1  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.43 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  27.32 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  25.5 
 
 
249 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  30.08 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  29.24 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>