198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003938 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  100 
 
 		 261 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  91.51 
 
 		 268 aa  454  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  78.66 
 
 		 282 aa  418  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  60.4 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  43.31 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  42.4 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  42.52 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  41.63 
 
 		 258 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  42.23 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  36.65 
 
 		 254 aa  165  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  40.39 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  40 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  39.61 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  39.61 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  39.61 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  39.61 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  39.61 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  39.61 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  39.61 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  39.61 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  39.22 
 
 		 259 aa  152  5e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  38.72 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  37.65 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  37.21 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  32.1 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  38.58 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  35.69 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  35.34 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  37.75 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  36.36 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  36.65 
 
 		 256 aa  121  9e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  36.25 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  36.51 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  34.52 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  34.62 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  36.41 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  37.02 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  36.32 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  31.33 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  34.41 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  35.91 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  36.27 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  33.52 
 
 		 250 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  35.32 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  34 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  32.11 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  34.45 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.92 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  32.12 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.78 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  26.8 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  33.53 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  28.7 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  26.92 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30.22 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  23.53 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.59 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  26.88 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  35.33 
 
 		 206 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  30.73 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.05 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  25.97 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.56 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.56 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  28.31 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.67 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.7 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  28.02 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  26.76 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  25.42 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.48 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  27.85 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  29.82 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.92 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  24.9 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  27.5 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  27.83 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  26.5 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  26.99 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  26.49 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  26.29 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  25.19 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  27.52 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  28.33 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  29.94 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  27.64 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  27.2 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  28.21 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  26.25 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  26.89 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  31.03 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>