248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4373 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  93.13 
 
 
262 aa  507  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  57.52 
 
 
262 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  41.7 
 
 
266 aa  195  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  42.73 
 
 
235 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  38.37 
 
 
268 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  37.98 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  37.4 
 
 
280 aa  175  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  34.62 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  34.62 
 
 
267 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  34.1 
 
 
264 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  34.48 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  34.47 
 
 
264 aa  143  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  34.83 
 
 
262 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  141  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  32.69 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  34.44 
 
 
267 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  34.22 
 
 
268 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  37.62 
 
 
278 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  34.63 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  36.15 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  36.82 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  33.95 
 
 
281 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  33.49 
 
 
275 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  36.15 
 
 
280 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.76 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
265 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
265 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.71 
 
 
263 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.48 
 
 
263 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  33.66 
 
 
273 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  32.2 
 
 
260 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.62 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.27 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.01 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  31.47 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  34.82 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  34.82 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  29.06 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  32.16 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  24.88 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  28.02 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25.67 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.5 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  23.45 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  26.3 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  29.46 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.93 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.93 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  35.4 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  25 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  26.42 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  27.95 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.98 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  26.16 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  26.44 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  29.29 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  31.36 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  31.36 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  31.36 
 
 
240 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  30.83 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  31.36 
 
 
240 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  27.5 
 
 
215 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  26.45 
 
 
258 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  26.45 
 
 
258 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  25.1 
 
 
250 aa  62  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  26.45 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  26.45 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  25.66 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  26.45 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  35.05 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  27.18 
 
 
255 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  30.12 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  30.12 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  27.54 
 
 
199 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  29.31 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  27.06 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  28.44 
 
 
219 aa  58.9  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  24.72 
 
 
260 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  26.5 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  33.98 
 
 
206 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  28.89 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  31.28 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  26.67 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  32.06 
 
 
337 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  27.44 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  33.01 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  27.73 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  27.61 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  31.39 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  31.39 
 
 
224 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  27.61 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  27.61 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  27.61 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  27.61 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  27.61 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>