196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1732 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
250 aa  484  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  72.76 
 
 
251 aa  363  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  50.64 
 
 
251 aa  229  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  53.66 
 
 
250 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  49.8 
 
 
248 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  48.82 
 
 
246 aa  197  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  42.91 
 
 
249 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  31.47 
 
 
236 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  31.4 
 
 
262 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.18 
 
 
260 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.02 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.86 
 
 
265 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.86 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.29 
 
 
251 aa  93.2  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.62 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.05 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.5 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.05 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  35 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  33.14 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  26.48 
 
 
273 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.85 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  33.48 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.42 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  30.94 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  32.78 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  31.11 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  29.74 
 
 
281 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  29.96 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  29.9 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  33.87 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  32.39 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  30.69 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  30.69 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  30.27 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  30.51 
 
 
280 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.12 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  32.22 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  25.23 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  32.18 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  30.09 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  25.58 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  29.25 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.25 
 
 
268 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  25.1 
 
 
262 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  32.29 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  31.02 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.03 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  36.92 
 
 
199 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  27.24 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  30.29 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.65 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  45.07 
 
 
252 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  30.74 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  29.14 
 
 
264 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  27.17 
 
 
252 aa  58.5  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  25.58 
 
 
260 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 
264 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  30.68 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  27.67 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  23.21 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  33.77 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  28.73 
 
 
193 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  29.75 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  33.06 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  28.02 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  31.05 
 
 
253 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  26.54 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  32.95 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  27.48 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  32.78 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  28.05 
 
 
247 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  31.46 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  30.32 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  29.02 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  36.04 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  27.44 
 
 
282 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  28.04 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  29.35 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  28.04 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  33.78 
 
 
280 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.63 
 
 
213 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.14 
 
 
219 aa  52.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  32.91 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  31.82 
 
 
244 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  29.35 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  29.09 
 
 
230 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  31.11 
 
 
244 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  29.61 
 
 
257 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  30.65 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  31.61 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  31.07 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  25.62 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  28 
 
 
181 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  27.31 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0483  hypothetical protein  37.5 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  28.26 
 
 
195 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>