162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4845 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  95.26 
 
 		 253 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  94.86 
 
 		 253 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  87.75 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  66.01 
 
 		 256 aa  339  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  71.94 
 
 		 259 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  66.01 
 
 		 256 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  66.01 
 
 		 256 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  66.01 
 
 		 253 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  65.22 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  62.83 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  36.99 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  42.94 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  43.89 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  35.06 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  40.79 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  42.78 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  42.63 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.01 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  42.86 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  37.36 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  44.19 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  34.66 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  37.75 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.8 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  39.72 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  38.18 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 242 aa  93.2  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  33.07 
 
 		 266 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  33.2 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  29.7 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  31.46 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.41 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  31.2 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.13 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  31.43 
 
 		 237 aa  72  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  30.92 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.41 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  25.79 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  35.85 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.18 
 
 		 214 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  30.16 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.55 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27.45 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  27.82 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  28.44 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  34.09 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  34.09 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.07 
 
 		 265 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  34.09 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  27.83 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  34.09 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  34.09 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  34.09 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  25.1 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  25.59 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  28.04 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  24.8 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32.47 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  34.08 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  29.81 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  25.81 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  33.15 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  35.83 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  34.85 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  29.75 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  26.14 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  36.56 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  36.42 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  29.07 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  33.15 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.74 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  33.71 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  28.63 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  40.62 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  38.78 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  48.21 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  30.38 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  31.46 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  31.94 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  37.72 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  33.15 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  31.46 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.94 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  31.46 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  28.02 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  28.95 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  24.58 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  23.08 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  33.12 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  28.45 
 
 		 224 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  28.75 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  28.74 
 
 		 272 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  29.78 
 
 		 224 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.96 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  29.44 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>