209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3555 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  541  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  48.24 
 
 		 267 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  49.42 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  48.1 
 
 		 278 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  46.61 
 
 		 278 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  46.44 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  48.21 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  51.07 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  49.3 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  48.37 
 
 		 264 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  42.52 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  46.05 
 
 		 264 aa  175  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  48 
 
 		 264 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  50.23 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  45.18 
 
 		 262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  39.92 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  42.15 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  43.61 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  40.49 
 
 		 268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  39.68 
 
 		 268 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  35.66 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  37.23 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  34.76 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  39.23 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  41.31 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  33.81 
 
 		 262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  40.85 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  40.54 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  34.3 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  32.04 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.78 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  33.89 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.39 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  35.83 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  29.71 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.23 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.98 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  33.9 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28.85 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.94 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.92 
 
 		 249 aa  72  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  32.74 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  33.2 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.63 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  28.63 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.38 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  31.07 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  30.47 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  30.51 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  34.76 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  32.56 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  32.56 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.95 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  33.52 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  31.05 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  33.52 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.53 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  35.29 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  32.6 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  28.96 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  32.31 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  40.59 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  30.77 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  35.5 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  30.32 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.86 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.97 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  32.12 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  29.01 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  29.01 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  29.01 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  31.05 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  35.64 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  28.4 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  36.73 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  29.63 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  24.51 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  36.73 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  28.4 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  27.78 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  28.4 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  37.06 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  31.12 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  31.98 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  30.56 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  35.17 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  27.37 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  35.8 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  28.22 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  29.59 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>