170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1490 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  97.77 
 
 
260 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  90.62 
 
 
224 aa  427  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  83.04 
 
 
224 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  82.59 
 
 
224 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  77.68 
 
 
281 aa  370  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  62.39 
 
 
301 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  60.18 
 
 
240 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  60.18 
 
 
240 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  60.18 
 
 
240 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  60.18 
 
 
240 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  60.18 
 
 
240 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  60.18 
 
 
240 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  49.33 
 
 
225 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  47.81 
 
 
228 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  46.67 
 
 
262 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  44 
 
 
251 aa  154  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  42.29 
 
 
251 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  42.29 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  35.11 
 
 
253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  33.93 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  33.93 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  33.93 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  33.93 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  33.93 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  33.93 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  33.93 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  35.47 
 
 
255 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  31.8 
 
 
258 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  31.43 
 
 
263 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  28.44 
 
 
277 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.46 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  24.77 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  36.08 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  28.24 
 
 
267 aa  72.4  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  35 
 
 
280 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  29.75 
 
 
284 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  34.09 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  26.02 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  27.63 
 
 
260 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  31.76 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  22.77 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25 
 
 
256 aa  58.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4822  hypothetical protein  27.98 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.953087  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  30.3 
 
 
253 aa  58.2  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  33.09 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  36.73 
 
 
275 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  30.77 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.09 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.16 
 
 
251 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  25 
 
 
272 aa  56.6  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.09 
 
 
278 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  30.82 
 
 
336 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  25 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28 
 
 
263 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  30.09 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  28.81 
 
 
259 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  34.02 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  31.46 
 
 
253 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  36.84 
 
 
262 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  35.11 
 
 
280 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  31.46 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  35.48 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  27.04 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2382  hypothetical protein  29.55 
 
 
322 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2428  hypothetical protein  29.55 
 
 
322 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.445616  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  27.04 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  28.72 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  34.35 
 
 
280 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  30.66 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  26.42 
 
 
264 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  28.57 
 
 
342 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  27.47 
 
 
263 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  37.23 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  33.83 
 
 
281 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  24.17 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  33.56 
 
 
334 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  32.43 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 
264 aa  52.4  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  25.93 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  34.09 
 
 
252 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  30.9 
 
 
253 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  32.54 
 
 
199 aa  52  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  34.85 
 
 
278 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  36.47 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  25 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  29.02 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  34.21 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  38.04 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  25.69 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  26.76 
 
 
287 aa  50.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  29.3 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  25.69 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  25.93 
 
 
237 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  27.93 
 
 
271 aa  50.8  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3467  hypothetical protein  26.09 
 
 
345 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  28.18 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  28.18 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>