163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2681 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  98.4 
 
 
250 aa  505  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  32.13 
 
 
246 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  34.52 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  35.27 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  30.77 
 
 
254 aa  118  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  35.55 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  37.84 
 
 
282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  34.33 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  34.33 
 
 
248 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  34.81 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  35.65 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.8 
 
 
260 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  34.07 
 
 
258 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  33.49 
 
 
248 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  33.82 
 
 
282 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  30.96 
 
 
250 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  34.07 
 
 
261 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  29.37 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31.25 
 
 
258 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  31.25 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  32.57 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  32.04 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  30.8 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  30.8 
 
 
258 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  30.8 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  32.73 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  32.97 
 
 
259 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  30.73 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  31.54 
 
 
268 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.3 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  29.41 
 
 
287 aa  90.1  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  30.39 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  31.16 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  33.87 
 
 
231 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.39 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.52 
 
 
260 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  31.65 
 
 
244 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  34.01 
 
 
264 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  32.29 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  31.77 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.25 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.25 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  30.36 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.25 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.41 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  25.88 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  28.42 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  30.58 
 
 
255 aa  79  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  28.85 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  28.84 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.41 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  31.77 
 
 
264 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  26.69 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  29.36 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  29.44 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  29.86 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.05 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.09 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  28.74 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.09 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.9 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  28.97 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  31.95 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  26.36 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  29.59 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.23 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.21 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  31.18 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  28.57 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.33 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  28.35 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.83 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  28.51 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  32.11 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  27.32 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  27.52 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  31.28 
 
 
273 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 
264 aa  63.2  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  26.48 
 
 
236 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  26.38 
 
 
342 aa  62.4  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  25.82 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  29.31 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  26.15 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  30.97 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  27.39 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  27.39 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  27.39 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  27.39 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  27.39 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>