270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1541 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  35.45 
 
 
256 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  34.6 
 
 
266 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  34.6 
 
 
264 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  33.01 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.81 
 
 
251 aa  111  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  37.43 
 
 
236 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  38.37 
 
 
237 aa  101  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  39.29 
 
 
237 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  30.57 
 
 
261 aa  95.5  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  33.01 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.49 
 
 
260 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  31.78 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  33.16 
 
 
247 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  31.53 
 
 
263 aa  91.7  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  31.46 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.88 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  30.57 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  29.26 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.64 
 
 
280 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  29.67 
 
 
251 aa  88.2  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.95 
 
 
263 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  27.1 
 
 
267 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  31.28 
 
 
246 aa  85.9  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.29 
 
 
264 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.51 
 
 
280 aa  85.5  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  30.88 
 
 
259 aa  85.5  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  29.15 
 
 
258 aa  84.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  29.3 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  30.77 
 
 
264 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  31.22 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  32.04 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.03 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  31.68 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  32.12 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  29.67 
 
 
251 aa  81.3  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  30.04 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  30.22 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  34.87 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  30.1 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  29.95 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  28.3 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  29.73 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  30.39 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  29.19 
 
 
272 aa  79  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.85 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  30.37 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  25.35 
 
 
280 aa  79  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  30.73 
 
 
244 aa  79  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28.71 
 
 
282 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  30.1 
 
 
255 aa  79  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  29.29 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  26.52 
 
 
265 aa  78.2  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  27.45 
 
 
264 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  32.41 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  25.23 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  26.47 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  31.67 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  27.06 
 
 
263 aa  77  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  28.22 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  28.71 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  26.22 
 
 
271 aa  77  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  26.96 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  30.12 
 
 
287 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.77 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  31.11 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  29.02 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  28.16 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  28.1 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  27.06 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  25.88 
 
 
268 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  31.71 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.14 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  28.97 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  31.9 
 
 
250 aa  74.7  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  24.77 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  24.77 
 
 
224 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  29.24 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  28 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.83 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  25.82 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  28 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  25.59 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  24.77 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  25.35 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  31.73 
 
 
268 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  27.7 
 
 
262 aa  71.6  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  28.77 
 
 
262 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  31.34 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  27.15 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>