210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0413 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  40.07 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  37.45 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  37.22 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  40.53 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  39.7 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  39.41 
 
 		 262 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  37.55 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  37.17 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  39.77 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  37.22 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  35.98 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  33.97 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  36.19 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  32.82 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  37.12 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  37.69 
 
 		 281 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  35.61 
 
 		 267 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  35.34 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  35.47 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  35.09 
 
 		 268 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  34.21 
 
 		 278 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  33.58 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  38.94 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  34.6 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  33.17 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  32.31 
 
 		 251 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.53 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  31.62 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  31.9 
 
 		 272 aa  92  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.12 
 
 		 237 aa  85.1  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.12 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  27.75 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.34 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.19 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.48 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.85 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  34.6 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  34.6 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.3 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  33.78 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  26.17 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  30.35 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  27.62 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  29.7 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  28.02 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  25.09 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  27.98 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  28.71 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  27.17 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  29.22 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  25.86 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  30.2 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  36.3 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  25.69 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  28.07 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  27.06 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  24.11 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  26.98 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  25.83 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  28.27 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  30.48 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  33.56 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371656 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  27.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  27.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  27.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  29.52 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  27.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  27.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  27.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  34.15 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  27.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  27.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  27.6 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  27.6 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  31.1 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  27.6 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  27.6 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.99 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.11 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  27.48 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.99 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  27.6 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  23.85 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  31.49 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1335  hypothetical protein  35.29 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  25.23 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  34.62 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0483  protein of unknown function DUF218  33.03 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.470585 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1526  hypothetical protein  34.31 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.107471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1498  hypothetical protein  34.31 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00465852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1645  hypothetical protein  33.64 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.840516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  27.55 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  26.63 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1488  hypothetical protein  31.85 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1711  hypothetical protein  31.85 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  30.46 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>