155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4693 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
247 aa  491  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  37.24 
 
 
251 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  41.32 
 
 
251 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  42.53 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  40 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  34.52 
 
 
256 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  38.81 
 
 
256 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  37.81 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  37.99 
 
 
230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  37.55 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  37.55 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  38.67 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  36.53 
 
 
253 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  39.02 
 
 
215 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  34.8 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  35.18 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  37.45 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  37.19 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  34.39 
 
 
253 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  38.04 
 
 
253 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  34.39 
 
 
253 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  43.87 
 
 
259 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  35.18 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  37.16 
 
 
253 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  39.41 
 
 
255 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  37.64 
 
 
247 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.82 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.76 
 
 
251 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.67 
 
 
263 aa  88.6  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  30.52 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.91 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.14 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  29.63 
 
 
256 aa  82  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.96 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.77 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  32.2 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  24.17 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  33.2 
 
 
280 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.94 
 
 
261 aa  72  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  33.19 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.58 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  31.39 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.58 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  35.4 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  30.89 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  32.41 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  32.65 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  32.74 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.09 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.86 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  28.8 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  30.05 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  31.53 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  30.49 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  37.89 
 
 
272 aa  62  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  33.94 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  30.95 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.92 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.89 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.72 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  31.28 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.78 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  29.73 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  39.56 
 
 
264 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  29.11 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  29.44 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  26.43 
 
 
251 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.41 
 
 
278 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  28.88 
 
 
265 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  41.49 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  34.59 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  29.65 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 
334 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  32.06 
 
 
280 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  36.26 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  28.98 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  32.34 
 
 
206 aa  52.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  35.48 
 
 
236 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  34.75 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  32.24 
 
 
199 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  31.84 
 
 
252 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  36.15 
 
 
262 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  31.68 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.87 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  31.68 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  26.47 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  31.88 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  29.94 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  30.95 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  28.05 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  26.24 
 
 
264 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  36.56 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.54 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  36.56 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  31.06 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  31.06 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  31.06 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  31.06 
 
 
240 aa  48.9  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>