187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1055 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  99.61 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  99.61 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  98.84 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  98.45 
 
 		 258 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  89.84 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  89.84 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  89.84 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  89.84 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  89.84 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  89.84 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  89.84 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  89.84 
 
 		 259 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  89.45 
 
 		 259 aa  423  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  81.01 
 
 		 259 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  67.18 
 
 		 282 aa  318  6e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  65.52 
 
 		 282 aa  311  9e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  64.86 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  65.49 
 
 		 258 aa  298  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  62.95 
 
 		 257 aa  279  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  41.31 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  42.86 
 
 		 287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  41.57 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  40 
 
 		 261 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  36.54 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  38.46 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  35.57 
 
 		 254 aa  141  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  39.6 
 
 		 255 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  32.43 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  35.04 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  34.08 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  34.65 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  34.9 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  35.2 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  41.29 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  36 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  35.6 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.45 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  37.69 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  34.84 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  34.4 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  35.2 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  37.89 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  34.8 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  34.52 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.02 
 
 		 280 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  37.68 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  34.26 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  35.64 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  28.06 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  34.26 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.71 
 
 		 242 aa  96.3  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  33.8 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.69 
 
 		 281 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  29.37 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  30.09 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  31.65 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  28.24 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  31.22 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  28.03 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  29.63 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  28.68 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  31.08 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  33.77 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  28.7 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  32.43 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  34.44 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.03 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  29.03 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.51 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.87 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  31.11 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  29.21 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.51 
 
 		 237 aa  72  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  31.1 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.3 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  29.49 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  26.05 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  27.36 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.31 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  30.7 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  28.14 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.11 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  26.85 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  27.63 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  26.89 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  29.08 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  32.09 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  26.89 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.07 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  24.2 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  29.01 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.64 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  29.63 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  30.13 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  25.86 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  34.29 
 
 		 265 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>