128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1471 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  98.79 
 
 
248 aa  500  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  97.58 
 
 
248 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  97 
 
 
233 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  82.17 
 
 
231 aa  362  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  72.31 
 
 
244 aa  332  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  71.07 
 
 
244 aa  332  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  70.66 
 
 
244 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  69.83 
 
 
244 aa  321  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  58.26 
 
 
246 aa  300  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  58.78 
 
 
264 aa  290  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  59.09 
 
 
251 aa  275  6e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  57.02 
 
 
256 aa  265  7e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  53.44 
 
 
252 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  50.41 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  48.83 
 
 
264 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  37.55 
 
 
255 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  36.9 
 
 
287 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  33.73 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  35.69 
 
 
282 aa  119  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  36.7 
 
 
268 aa  118  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  38.31 
 
 
264 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  36.84 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  36.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  36.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  34.33 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  36.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  36.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  36.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  36.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  36.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  36.4 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  35.32 
 
 
261 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  36.28 
 
 
258 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  30.71 
 
 
254 aa  111  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  36.28 
 
 
258 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  35.84 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  35.84 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  31.45 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  35.84 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  35.06 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  35.75 
 
 
259 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  32.68 
 
 
259 aa  106  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.53 
 
 
282 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  33.48 
 
 
250 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  32.29 
 
 
282 aa  101  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  34.69 
 
 
258 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  34.67 
 
 
257 aa  92  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  34.19 
 
 
250 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.47 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  34.87 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27.6 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  29.1 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.86 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  28.79 
 
 
268 aa  72  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.71 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.53 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  29.33 
 
 
264 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  32.16 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.05 
 
 
268 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  26.89 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.99 
 
 
214 aa  62.4  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  26.78 
 
 
251 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  29.05 
 
 
268 aa  62  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  29.15 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.39 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  32.81 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  32.81 
 
 
278 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  26.47 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  27.27 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  28.44 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  26.95 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.69 
 
 
278 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  31.72 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  28.25 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  26.2 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.21 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  30.2 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  30.35 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  34.56 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.04 
 
 
284 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.21 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.69 
 
 
265 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  26.72 
 
 
281 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  25.97 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  31.22 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  34.65 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  32.87 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  24.64 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  33.86 
 
 
280 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  22.83 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1772  hypothetical protein  29.87 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  28.06 
 
 
268 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  26.55 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  25.63 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  26.55 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  26.55 
 
 
255 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>