182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2002 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  34.66 
 
 
282 aa  159  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  38.42 
 
 
268 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  34.98 
 
 
254 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  37.2 
 
 
261 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  33.65 
 
 
287 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  37.56 
 
 
282 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  37.56 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  31.76 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  36.36 
 
 
258 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  37.24 
 
 
257 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  33.6 
 
 
259 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  37.88 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  37.88 
 
 
258 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  37.88 
 
 
258 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  37.06 
 
 
259 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  37.37 
 
 
258 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  37.37 
 
 
258 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  34.94 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  30.77 
 
 
250 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  35.03 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  34.59 
 
 
250 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  33.2 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  30.71 
 
 
248 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 
260 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  27.56 
 
 
268 aa  108  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  30.71 
 
 
248 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  36.53 
 
 
251 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  32 
 
 
252 aa  102  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  30.31 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  29.73 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  25 
 
 
280 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  29.88 
 
 
244 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  30.4 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  30.86 
 
 
264 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  28.69 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  26.48 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  29.02 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  28.44 
 
 
235 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  30.26 
 
 
233 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  27.95 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  24.81 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  27.95 
 
 
268 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  29.37 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  30.14 
 
 
250 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  28.79 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  26.46 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  28.27 
 
 
231 aa  85.9  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  27.78 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  27.78 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  30.99 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.35 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  26.95 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  24.9 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  27.94 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  28.3 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  26.48 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  26.07 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  25.57 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  24.88 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.55 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.87 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.87 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  22.99 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  25.58 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  23.53 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  23.9 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.35 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.81 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  25.29 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  29.35 
 
 
264 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  27.65 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.43 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  29.94 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  26.05 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  26.45 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  26.32 
 
 
263 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  27.01 
 
 
280 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  25.19 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  25.89 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  23.85 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  25.12 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  25.38 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  26.52 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  27.54 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  23.83 
 
 
262 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  27.31 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>