165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1429 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  503  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  58.26 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  59.67 
 
 		 264 aa  298  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  58.26 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  58.26 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  58.44 
 
 		 256 aa  285  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  61.16 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  58.26 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  54.37 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  56.79 
 
 		 244 aa  248  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  54.55 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  56.09 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  53.31 
 
 		 244 aa  242  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  54.13 
 
 		 244 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  49.01 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  49.79 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  41.8 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  35.25 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  32.13 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  36.25 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  34.25 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  37.27 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  37.69 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  35.48 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  35.65 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  39.23 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  39.23 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  39.23 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  39.23 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  39.23 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  39.23 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  39.23 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  39.23 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  39.23 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  35.78 
 
 		 258 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  35.78 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  35.78 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  35.78 
 
 		 258 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  34.16 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  35.32 
 
 		 258 aa  98.6  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  28.85 
 
 		 268 aa  95.1  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  34 
 
 		 259 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  32.73 
 
 		 282 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  34.78 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  36.07 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  31.82 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  29.37 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  34.25 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.28 
 
 		 214 aa  85.9  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  28.63 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.68 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.9 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.55 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 		 215 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.36 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  28.5 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.94 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  28.22 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  27.67 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.09 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  26.28 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.95 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.44 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  32.51 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  33.15 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  28.99 
 
 		 262 aa  62  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  24.77 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  26.26 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.66 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0376  protein of unknown function DUF218  29.29 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.48 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  27.03 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.26 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  31.78 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  28.8 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  26.22 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  27.75 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  28.28 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  27.64 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  25.33 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  30.31 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  25.71 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  30.25 
 
 		 275 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>