207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1910 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  72.76 
 
 		 250 aa  350  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  52.61 
 
 		 250 aa  241  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  48.1 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  49.17 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  44.91 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  42.06 
 
 		 249 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  34.33 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.42 
 
 		 262 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  33.6 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.23 
 
 		 263 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.36 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  30.36 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  29.02 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.63 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  31.58 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  25.3 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  28.97 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  27.69 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  28.57 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  26.54 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  33.52 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  28.98 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.83 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  28.9 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  25.67 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  36.97 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  32.04 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  32.8 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30.46 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  33.18 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  27.27 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.71 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  31.32 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  30.68 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  29.71 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  27.62 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.68 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  28.25 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  29.78 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  27.95 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  34.03 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  30.73 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  29.84 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  30.92 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  32.43 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  28 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  34.64 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27.24 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  30.36 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  26.18 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  26.92 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  27.2 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.3 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  26.86 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  33.18 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  29.7 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  29.21 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  27.2 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  31.43 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  29.47 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  29.02 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  23.72 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  32.14 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  27.5 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  24.06 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  26.89 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  30.81 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.1 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  26.43 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  29.75 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  26.22 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  31.4 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  27.52 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  29.33 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  29.33 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  29.33 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  30.89 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  30.91 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  30.91 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  30.12 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2261  protein of unknown function DUF218  31.9 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  30.91 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  27.86 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  30.91 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  29.33 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  30.91 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  30.91 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  30.91 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  30.91 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  28.11 
 
 		 271 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  31.25 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  29.41 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  27.6 
 
 		 282 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  26.62 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>