121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1206 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01315  hypothetical protein  28.4 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  29.79 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.67 
 
 
214 aa  88.2  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  27.67 
 
 
254 aa  85.9  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  29.79 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  24.19 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  27.65 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  30 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  30 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  28.87 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  27.83 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.26 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  28.95 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  28.8 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  30.12 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  29.1 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  28.95 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  29.1 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  29.05 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  27.84 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  28.95 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  28.95 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  28.95 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  28.95 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  27.19 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  28.57 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  28.95 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  28.34 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  27.81 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  28.88 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  27.81 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  23.32 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  27.8 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  29.47 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  29.47 
 
 
250 aa  67  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  28.04 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  30.34 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  26.19 
 
 
268 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  30.34 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  30.15 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  27.8 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  27.89 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  30.68 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  34.85 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.24 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  24.51 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.24 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  28.57 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.47 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  29.69 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  26.77 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  29.3 
 
 
260 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  28.48 
 
 
263 aa  56.6  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  31.13 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  29.74 
 
 
259 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  26.52 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  27.5 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  26.7 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  28.87 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  25.7 
 
 
253 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  25.73 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  26.18 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  25.85 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  26.32 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  27.84 
 
 
253 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  25.57 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  26.42 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  25.23 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  29.46 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  26.58 
 
 
278 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  24.5 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  30.21 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  22.55 
 
 
255 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  30.21 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  27.52 
 
 
251 aa  47  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  26.67 
 
 
255 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  34.83 
 
 
259 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  25.81 
 
 
272 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  24.57 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  23.41 
 
 
261 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  25.25 
 
 
251 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  24.72 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  39.06 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>