251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3403 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  547  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  97.86 
 
 		 280 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  44.66 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  39.77 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  41.18 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  43.13 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  40 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  37.79 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  39.23 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  39.38 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  37.69 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  39.53 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  38.72 
 
 		 266 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  39 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  39.3 
 
 		 265 aa  148  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  39.92 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  40.46 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  39.84 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  36.74 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  37.22 
 
 		 264 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  36.96 
 
 		 262 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  35.38 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  36.15 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  40 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  41.3 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  34.23 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  38.33 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0242  hypothetical protein  31.02 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  34.72 
 
 		 251 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.06 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  31.64 
 
 		 214 aa  89  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.85 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  31.33 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.81 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  28.47 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  29.88 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  35.29 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  30.2 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  32.86 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  29.19 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.5 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  27.14 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  37.21 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  30.14 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  35.15 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  29.63 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  35.2 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  31.46 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  29.59 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.48 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2157  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  29.48 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  28.97 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.48 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  31.25 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  32.6 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  29.33 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  30.4 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  32 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  26.42 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  32.37 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  39.58 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  30.37 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0022  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  28.46 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  25.55 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  29.52 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  39.81 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  28.98 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  28.04 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  28.92 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  35.38 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  29.85 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  35.38 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  34.65 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3064  hypothetical protein  35.44 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  32.32 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  34.65 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2261  hypothetical protein  35.44 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  29.17 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  37.61 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2312  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.927622  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  30.86 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>