147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1442 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  522  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  64.37 
 
 		 264 aa  317  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2936  hypothetical protein  63.82 
 
 		 251 aa  306  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0201692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1429  hypothetical protein  58.44 
 
 		 246 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0479174  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  57.02 
 
 		 248 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1476  hypothetical protein  57.44 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  57.44 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  52.23 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2876  protein of unknown function DUF218  56.52 
 
 		 233 aa  251  7e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.380038  hitchhiker  0.0000392401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2615  hypothetical protein  54.51 
 
 		 244 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175692  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2682  hypothetical protein  54.1 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566632  unclonable  0.000043441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2789  hypothetical protein  54.13 
 
 		 244 aa  245  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1657  hypothetical protein  53.69 
 
 		 244 aa  241  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1372  hypothetical protein  55.6 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2230  hypothetical protein  53.09 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.951055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2600  hypothetical protein  48.82 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0668  hypothetical protein  41.74 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  35.66 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  38.02 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  31.2 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  40.72 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  39.18 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  32.56 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  35.92 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  38.86 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  38.34 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  38.34 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  38.34 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  38.34 
 
 		 258 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  37.37 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  28 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  37.5 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  31.5 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  36.32 
 
 		 259 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  31.35 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  28.79 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  27.6 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  36.84 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  33.05 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  33.68 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  34.19 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  34.98 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  35.2 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  29.92 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  29.92 
 
 		 237 aa  86.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.58 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  31.95 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  30.6 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  30.14 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  30.59 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  30.14 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  28.87 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  29.41 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  30.04 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  26.19 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  27.35 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  29.62 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  29.62 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  27.53 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  25.4 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  27.11 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.27 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  29.04 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.02 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  29.41 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  28.4 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  27.86 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  27.31 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  30.35 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  24.9 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  24.9 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.07 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  24.9 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  24.9 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  24.9 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  24.9 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  24.9 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  28.12 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  28.63 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.82 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.41 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  26.32 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  28.92 
 
 		 278 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  28.25 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  26.56 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  25.34 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  28 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  27.03 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>