161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0964 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  100 
 
 
244 aa  485  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  44.17 
 
 
242 aa  194  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  33.6 
 
 
261 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  32 
 
 
251 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  33.05 
 
 
237 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  33.05 
 
 
237 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  34.62 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  29.08 
 
 
251 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  30.43 
 
 
266 aa  92  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  30.43 
 
 
264 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  31.22 
 
 
215 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  33.03 
 
 
250 aa  89  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  32.72 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  29.23 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.34 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  32.67 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  33.98 
 
 
262 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  30.73 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.37 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  28 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  31.22 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2266  hypothetical protein  26.77 
 
 
268 aa  77  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  26.59 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  23.48 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  28.76 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  33.89 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  28.49 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  22.95 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27.42 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  22.73 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  33.71 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  27.71 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  28.25 
 
 
259 aa  72  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  29.85 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  27.73 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  29.69 
 
 
282 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1442  hypothetical protein  30.69 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000191712  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.02 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.02 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  26.18 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  29.07 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  23.39 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  27.17 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  30.73 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  27.17 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  30.95 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  28.52 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  25.86 
 
 
260 aa  65.1  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  24.71 
 
 
262 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  27.49 
 
 
253 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  26.14 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  26.85 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  26.18 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  29.76 
 
 
264 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  28.38 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  24.42 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  27.41 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  26.46 
 
 
264 aa  60.1  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  25.58 
 
 
280 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.44 
 
 
263 aa  59.3  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  25.48 
 
 
267 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  30.5 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  26.27 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1721  hypothetical protein  30.2 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.944065  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  29.29 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  28.92 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  30.17 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3086  hypothetical protein  24.54 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  26.44 
 
 
256 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  28.33 
 
 
264 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  27.01 
 
 
259 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  25.37 
 
 
280 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  27.12 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  25.37 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  29.05 
 
 
264 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  29.21 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  26.91 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  23.33 
 
 
256 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  24.09 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  27.97 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  31.68 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  24.58 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1471  hypothetical protein  27.41 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135208  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  26.34 
 
 
287 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  30.85 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  33.68 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  31.25 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  31.25 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  24.76 
 
 
275 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  26.3 
 
 
281 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  31.25 
 
 
259 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>